小麦中miR164的靶基因鉴定及其在衰老过程中的表达

作     者：王玉杰 顾鹏程 许静玉 胡尚钦 汪军成 姚立蓉 司二静 马小乐 杨轲 张宏 王化俊 李葆春 WANG Yujie;GU Pengcheng;XU Jingyu;HU Shangqin;WANG Juncheng;YAO Lirong;SI Erjing;MA Xiaole;YANG Ke;ZHANG Hong;WANG Huajun;LI Baochun

作者机构：甘肃农业大学生命科学技术学院甘肃兰州730070 干旱生境作物学国家重点实验室/甘肃省作物遗传改良与种质创新重点实验室甘肃兰州730070 甘肃农业大学农学院甘肃兰州730070 

出 版 物：《麦类作物学报》 (Journal of Triticeae Crops)

年 卷 期：2024年第44卷第4期

页      面：407-414页

核心收录：

学科分类：0710[理学-生物学] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0901[农学-作物学] 0836[工学-生物工程] 090102[农学-作物遗传育种] 

基　　金：国家自然科学基金项目(31960072,32001514) 国家现代农业产业技术体系项目(CARS-05-04B-2) 产业支撑计划项目(2021CYZC-12) 甘肃省自然基金项目(20JR10RA507) 干旱生境作物学国家重点实验室开放基金项目(GSCS-2021-05,GSCS-2016-3) 甘肃农业大学伏羲青年英才计划项目(Ganfx-03Y06) 甘肃农业大学国家级大学生创新创业训练计划重点支持领域项目(202110733001) 种业攻关和农业科技支撑项目(KJZC-2023-2) 

主　　题：miR164 小麦 衰老 靶基因 NAC 

摘      要：miR164是植物中一种重要的非编码RNA,对植物的生长发育具有重要作用。为了解miR164靶基因与小麦衰老的关系,本研究通过在线软件对小麦中miR164家族成员进行了鉴定并对其进行生物信息学和表达分析。结果表明,从小麦中共鉴定出13个miR164家族成员,其不均匀分布在9条染色体上。系统进化分析表明,13个小麦miR164与同属于禾本科单子叶植物的水稻亲缘关系较近。13个Tae-miR164均能形成稳定的二级结构,成熟序列碱基具有高保守性,仅有3个Tae-miR164成员在第21位存在差异,成熟序列产生于前体中具有碱基高保守性的第1~21位。Tae-miR164的靶基因中,有18个为NAC转录因子,占所有靶基因总数的75%,表明Tae-miR164的主要靶基因为NAC转录因子。Tae-miR164家族成员在小麦叶片中的表达量明显高于其他组织;在小麦叶片衰老过程中,与其他Tae-miR164靶基因相比,有3个Tae-miR164靶基因表达差异显著,其ID分别为TraesCS4A02G225100、TraesCS5B02G054800和TraesCS5A02G04910,其中TraesCS5A02G04910为NAC转录因子,推测NAC转录因子与小麦叶片衰老密切相关。比较不同物种中miR164家族成员数量,发现miR164家族成员数量与物种基因组大小和物种亲缘关系无关。