利用QTL-Seq结合分子标记定位粳稻垩白粒率控制位点qChalk8

作     者：杜彦修 孙文玉 袁泽科 张倩倩 李富豪 李俊周 孙红正 

作者机构：河南农业大学农学院 

出 版 物：《中国水稻科学》 (Chinese Journal of Rice Science)

年 卷 期：2024年

核心收录：

学科分类：09[农学] 0901[农学-作物学] 

基　　金：河南省自然科学基金(232300421156) 河南现代农业水稻产业技术体系(HARS-22-03-G3) 

主　　题：水稻 垩白 QTL-Seq QTL定位 

摘      要：【目的】垩白是影响稻米外观品质的重要性状，对其遗传控制QTL位点的定位研究是基因克隆和提高稻米外观品质的前提和基础。本研究旨在利用QTL-Seq和分子标记作图定位粳稻垩白粒率调控相关的QTL。【方法】利用高垩白粳稻材料拉木加和低垩白粳稻品种水晶3号构建F2分离群体，将两份独立的F2群体分别种植于河南原阳和海南三亚，两个群体单株垩白粒率考种后分别选取极端个体混池进行QTL-Seq分析，然后使用分子标记作图对稳定的QTL进行验证。【结果】两个F2群体的QTL-Seq分析发现第8染色体存在一个较为稳定的QTL位点qChalk8。进一步通过分子标记作图将该QTL定位于17.6-18.5 Mb之间，该QTL位点的LOD值为7.08，表型贡献率为15.9%。【结论】利用QTL-Seq和分子标记作图定位了粳稻垩白粒率相关QTL-qChalk8，为粳稻垩白调控基因进一步的精细定位和基因克隆奠定了基础。