发育不良和歪头病对变态末期棘胸蛙皮肤菌群的影响

作     者：徐杨 江昀 侯金亮 李娟 冯兴浪 刘新华 李德亮 向建国 李军华 XU Yang;JIANG Yun;HOU Jin-Liang;LI Juan;FENG Xing-Lang;LIU Xin-Hua;LI De-Liang;XIANG Jian-Guo;LI Jun-Hua

作者机构：湖南农业大学水产学院长沙410128 

出 版 物：《水生生物学报》 (Acta Hydrobiologica Sinica)

年 卷 期：2024年第48卷第5期

页      面：839-848页

核心收录：

学科分类：0908[农学-水产] 09[农学] 

基　　金：国家自然科学基金(32173021) 湖南省自然科学基金(2021JJ30326) 湖南省现代农业科研体系(2019-105)资助 

主　　题：变态末期 发育不良 歪头病 皮肤微生物菌群 棘胸蛙 

摘      要：实验基于高通量测序技术,以健康(CTL组)、发育不良(DD组)和患歪头病(TD组)的棘胸蛙(Quasipaa spinosa)为研究对象,系统地探索宿主健康状态与皮肤微生物菌群组成、多样性及功能之间的潜在关系。所有样本经测序、质控及聚类获得2997条扩增子序列变体(ASVs),注释32个门,76个纲,167个目,259个科和402个属,其中变形菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)和拟杆菌门(Bacteroidota)为棘胸蛙皮肤主要优势菌门(1%),但丰度受宿主健康状态的影响。在属水平上筛选获得50个菌群标志物,其中23个(如乳杆菌(Lactobacillus)、德沃斯氏(Devosia)、希瓦氏菌(Shewanella)和Luteolibacter)在CTL组中相对丰度较高,提示棘胸蛙的健康状态;19个(如短稳杆菌(Empedobacter)、芽孢杆菌(Bacillus)和短螺旋体(Brevinema))在DD组中相对丰度较高,提示棘胸蛙发育不良的病症;8个(如伊丽莎白菌(Elizabethkingia)、柠檬酸杆菌(Citrobacter)和不动杆菌(Acinetobacter))在TD组中相对丰度较高,提示棘胸蛙歪头病的病症。多样性分析表明,TD组的多样性和均一度与CTL组和DD组相比显著降低,微生物菌群组成也表现出明显分离。功能预测表明,CTL组和TD组皮肤微生物菌群之间功能差异主要富集在新陈代谢相关通路。总之,该项研究揭示不同健康状态下棘胸蛙皮肤微生物菌群的组成和变化,突出共生微生物菌群在两栖动物健康养殖和疾病预防中的潜在应用。