黄梁木SAC磷酸酶蛋白家族的鉴定与分析

作     者：杨姝琦 王明俊 胡欣荃 龙健梅 彭昌操 Yang Shuqi;Wang Mingjun;Hu Xinquan;Long Jianmei;Peng Changcao

作者机构：华南农业大学林学与风景园林学院广州510642 

出 版 物：《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)

年 卷 期：2024年第22卷第9期

页      面：2882-2890页

学科分类：0907[农学-林学] 08[工学] 0829[工学-林业工程] 09[农学] 

基　　金：广东省林业科技创新重点项目(2016KJCX003,2019KJCX001) 国家重点研发计划项目(2016YFD0600104) 国家自然科学基金项目(30771759,31170636,31470681) 广东省自然科学基金项目(2016A030311032) 广州市科技计划项目(201607020024) 广东省高等教育青年创新人才基金项目(2017KQNCX017)共同资助 

主　　题：黄梁木 SAC磷酸酶 生物信息学 

摘      要：磷酸肌醇(PI)是多种细胞功能的重要调节剂,含有SAC(Suppressor of actin)结构域的磷酸肌醇磷酸酶参与PI合成,称为SAC磷酸酶,目前SAC磷酸酶在木本植物中研究较少,为了探究SAC磷酸酶对黄梁木的生长发育和抗逆性的影响,本研究利用生物信息学方法鉴定得到10个黄梁木SAC基因,并对其编码的蛋白进行系统进化和表达模式分析。结果显示,NcSACs蛋白序列长度为508~1734 aa,NcSACs蛋白有4个显酸性和6个显碱性,且均为亲水性蛋白,其中包含4个稳定蛋白,NcSACs蛋白具有多个潜在磷酸化位点,可通过磷酸化位点调节NcSACs酶活性。10个NcSACs蛋白都具有保守的SAC结构域,且NcSACs蛋白可根据C端序列的差异性被分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ3个亚型。系统进化分析也显示NcSACs分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ3种亚型,且NcSAC8和NcSAC9与At SAC6和AtSAC7亲缘关系较近,推测具有相近的功能,在植物根系伸长以及盐胁迫抗逆方面具有重要意义。通过转录组测序技术,对NcSACs进行表达模式分析,结果表明,NcSACs家族基因的表达有组织特异性,其中NcSAC4在果实、根系和老叶中有较高的表达量。本研究为深入研究NcSACs基因的功能以及探索SAC磷酸酶对林木生长发育及抗逆的影响提供了理论基础。