乙肝相关性肝癌中新基因CHCHD2的生物信息学分析

作     者：姚杨 苏杰 刘凯歌 徐锐 成碧萍 Yao Yang;Su Jie;Liu Kaige;Xu Rui;Cheng Biping

作者机构：西安医学院附属医院西安710077 

出 版 物：《生物技术通报》 (Biotechnology Bulletin)

年 卷 期：2012年第28卷第3期

页      面：179-185页

学科分类：1004[医学-公共卫生与预防医学(可授医学、理学学位)] 1002[医学-临床医学] 100214[医学-肿瘤学] 100401[医学-流行病与卫生统计学] 10[医学] 

基　　金：西安医学院附属医院基金项目(XYFY10-05) 

主　　题：乙肝相关性肝癌 基因芯片 CHCHD2 

摘      要：应用基因芯片技术获取以稳定转染HBx基因的肝癌细胞HepG2(HepG2-X)及非转染的肝癌细胞HepG2的差异表达的基因,利用生物信息学方法对新基因CHCHD2进行初步分析表明,该蛋白开放性读码框长456 bp,编码151个氨基酸残基,相对分子量为15.55 kD,等电点9.43,是主要定位于线粒体中的亲水性蛋白,二级结构均以α-螺旋和无规则卷曲为主要构件。同源性比较分析结果表明,其碱基序列与已经报道的其他17个物种相似性为64%-99%,且符合种属之间的进化关系。