基于生物信息数据库分析前列腺癌组织特异性lncRNA表达及临床意义

作     者：陈平舟 许清江 林煌 黄翔 吴翔 CHEN Pingzhou;XU Qingjiang;LIN Huang;HUANG Xiang;WU Xiang

作者机构：福建省立医院泌尿外科福建福州350004 福建医科大学附属南平市第一医院泌尿外科福建南平353000 

出 版 物：《现代泌尿外科杂志》 (Journal of Modern Urology)

年 卷 期：2024年第29卷第3期

页      面：232-237,267页

学科分类：1002[医学-临床医学] 100214[医学-肿瘤学] 10[医学] 

基　　金：福建省科技创新联合资金项目(No.2020Y9024) 

主　　题：前列腺癌 生物信息学 lncRNA 前列腺相关转录因子14 前列腺抗原3 

摘      要：目的研究前列腺癌组织特异性长链非编码RNA(lncRNA)表达及其临床意义。方法利用生物信息学方法深入分析TCGA及GEO基因组数据库,对数据库收录的492例前列腺癌组织和152例癌旁组织做基因差异分析,筛选出差异表达的lncRNA,并进一步分析上述lncRNA的前列腺组织特异性及对前列腺癌患者预后的影响。结果筛选出差异表达的5个lncRNA包括:前列腺相关转录因子14(PCAT14)、前列腺抗原3(PCA3)、C末端结合蛋白1-AS(CTBP1-AS)、DRAIC、GPC5-AS1。其中,PCAT14、PCA3在前列腺癌组织中特异性表达,二者升高提示与前列腺癌预后相关,且二者与激肽释放酶相关肽酶3(KLK3)、α-甲基酰基辅酶A消旋酶(AMACR)、溶质转运蛋白家族45A3(SLC45A3)等前列腺癌特异抗原相关性好。针对PCAT14、PCA3进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析提示:PCA3差异表达与吞噬作用、细胞识别、对细菌的防御反应、免疫球蛋白复合物、高尔基体、抗原结合、趋化因子受体结合、蛋白质消化吸收、肾素-血管紧张素系统等信号通路等密切相关;PCAT14差异表达与高尔基体、离子通道的活动相关通路,同时与肾素分泌、环磷酸腺苷(cAMP)信号通路、促性腺激素分泌相关信号通路等密切相关。结论PCA3、PCAT14在前列腺癌组织中特异性表达,在正常组织中基本不表达,可以作为前列腺癌诊断的潜在指标。