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长尾毛蕊茶(山茶科)植物的叶绿体全基因组序列(英文)

Complete Chloroplast Genome Sequence of Camellia caudata(Theaceae)

作     者:张晓玉 刘瑞瑞 刘兵兵 ZHANG Xiaoyu;LIU Ruirui;LIU Bingbing

作者机构:山西大学黄土高原研究所 陇东学院生命科学与技术学院 

出 版 物:《山西大学学报(自然科学版)》 (Journal of Shanxi University(Natural Science Edition))

年 卷 期:2024年第47卷第2期

页      面:464-467页

学科分类:0710[理学-生物学] 07[理学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0901[农学-作物学] 090102[农学-作物遗传育种] 

基  金:国家自然科学基金(41601055) 

主  题:山茶属 叶绿体基因组 系统发育分析 

摘      要:长尾毛蕊茶(Camellia caudata Wall. 1832)是一种小型乔木,它主要分布于南亚。它富含抗氧化组分,是一种重要的药用植物。本文基于Illumina平台的双末端测序数据首次报道并描述了长尾毛蕊茶的叶绿体全基因组序列。完整的叶绿体基因组长度为157 043 bp,由两个26 095 bp长的反向重复序列(IRs)以及被其分开的86 599 bp长的大单拷贝区(LSC)和18 272 bp长的小单拷贝区(SSC)组成。该质体基因组包含了89个蛋白质编码基因、37个tRNA基因、8个rRNA基因和1个假基因(ycf 2)。质体基因组总GC含量为37.3%。基于20个相关物种全叶绿体基因组的系统发育分析表明,长尾毛蕊茶与同属的大果南山茶(C. semiserrata var. magnocarpa)和毛蕊红山茶(C. mairei)亲缘关系较近。

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