4种绿潮藻响应高温胁迫的转录组学研究
Transcriptome on Response of Four Species of Green Tide Algae to Heat Stress作者机构:上海海洋大学海洋科学与生态环境学院上海201306 上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心上海201306
出 版 物:《水产科学》 (Fisheries Science)
年 卷 期:2024年第43卷第2期
页 面:199-214页
学科分类:09[农学] 0903[农学-农业资源与环境]
基 金:上海市自然科学基金资助项目(18ZR1417400)
摘 要:将2008年7月在青岛沿岸采集的黄海绿潮藻浒苔、扁浒苔、缘管浒苔及曲浒苔经最适条件下纯系培养后留存的子代分为2组(对照组和处理组),对照组在最适温度、处理组在30℃下培养24 h后,取出藻体,经液氮处理后于-80℃保存后直至提取RNA,进行RNA质控检测和转录组高通量测序。试验结果显示,4种浒苔差异基因个数依次为:扁浒苔曲浒苔浒苔缘管浒苔,这些差异基因主要富集在运输和分解代谢、脂质代谢、氨基酸代谢和能量代谢4部分代谢通路上,而浒苔差异基因特有的富集通路是氧化磷酸化、乙醛酸和二羧酸代谢和ABC转运体,这可能与浒苔响应高温胁迫特殊性有关。4种浒苔都具有完整的热休克蛋白合成和抗氧化物体系,扁浒苔热休克蛋白相关基因表达下调可能是其最不适应高温的原因。不同浒苔也会通过不同抗氧化物酶的表达来抵御高温,其中超氧化物歧化酶的作用最重要。试验结果可为进一步研究4种浒苔在绿潮暴发过程中的演替情况提供基础数据。