高通量构建与筛选信号肽库提高枯草芽孢杆菌外源蛋白的表达分泌

作     者：李昊霓 李颖 于思礼 涂然 花尔并 刘扬 王猛 LI Haoni;LI Ying;YU Sili;TU Ran;HUA Erbing;LIU Yang;WANG Meng

作者机构：天津科技大学生物工程学院天津300457 中国科学院天津工业生物技术研究所天津300308 

出 版 物：《微生物学报》 (Acta Microbiologica Sinica)

年 卷 期：2024年第64卷第8期

页      面：3059-3072页

核心收录：

学科分类：0710[理学-生物学] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0901[农学-作物学] 0836[工学-生物工程] 090102[农学-作物遗传育种] 

基　　金：国家重点研发计划(2021YFC2100201) 国家自然科学基金(32100046) 

主　　题：枯草芽孢杆菌 信号肽 外源蛋白分泌 自动化高通量筛选 

摘      要：【目的】基于信号肽在分泌表达系统中的重要作用,利用自动化高通量设备,搭建枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)酶蛋白信号肽库的高通量自动化构建与筛选平台,探索枯草芽孢杆菌中不同信号肽对酶蛋白的表达分泌作用。【方法】首先以大肠杆菌-芽孢杆菌穿梭载体pHP13以及pMA5为骨架,将编码毒性蛋白的ccdB基因插入大肠杆菌-芽孢杆菌穿梭载体的启动子和目标基因之间,构建针对绿色荧光蛋白(green fluorescent protein,GFP)以及普鲁兰酶(pullulanase,PulA)的信号肽筛选载体。以枯草芽孢杆菌168基因组为模板,扩增173条信号肽序列,基于高通量自动化设备搭建枯草芽孢杆菌外源蛋白表达及活性筛选平台,构建含有不同信号肽的外源蛋白重组菌株,筛选并考察不同信号肽对外源蛋白表达分泌的影响。【结果】RpmG、AspB、CitH、LytF和YkwD这5个信号肽具有较强的引导GFP胞外蛋白分泌能力,其中RpmG引导GFP胞外分泌能力最强,其重组菌株与对照菌株相比胞外GFP的荧光值提高了236%。针对PulA的信号肽筛选,其中41个信号肽与PulA的适配性很低,2个信号肽RpmG、AspB引导PulA胞外分泌的能力较强。含AspB信号肽的PulA重组菌株分泌率可达到74%,与对照菌株相比分泌率提高了68%;RpmG信号肽引导的PulA酶活与其他信号肽相比最高,总酶活可达116 U/mL,细胞外酶活为52 U/mL。【结论】本研究建立了枯草芽孢杆菌酶蛋白信号肽库的高通量自动化构建与筛选平台,分别获得可以提高GFP和PulA表达分泌的信号肽。该自动化平台允许大量样品的并行处理,这简化了纯手工的重复性实验工作,并且我们发现高通量实验平台不论在时间和成本方面都优于手工操作。自动化高通量平台的优势将随着样本量的增加而更加显著。综上所述,我们建立的自动化高通量筛选平台不仅可以加速外源蛋白的信号肽筛选优化过程,也为其他高附加值蛋白酶的工业菌种改造提升和迭代提供新的技术支撑。