番茄含糖量不同的两个材料果实转录组初步分析
Preliminary Transcriptome Analysis in Two Tomato Fruits Materials with Different Sugar Content作者机构:上海市农业科学院园艺研究所上海市设施园艺重点实验室上海201413 上海师范大学生命科学学院上海201400 安徽省农业科学院园艺研究所合肥230031
出 版 物:《园艺学报》 (Acta Horticulturae Sinica)
年 卷 期:2024年第51卷第2期
页 面:281-294页
核心收录:
学科分类:09[农学] 0902[农学-园艺学] 090202[农学-蔬菜学]
基 金:上海市科技兴农项目[沪农科推字(2022)第1-7号]
摘 要:以高含糖量(8%)和普通含糖量(4.5%)番茄为研究材料,选取绿熟期、转色期、粉红期和红熟期的果实样品,通过转录组测序比较两种材料间的基因表达差异。分析表明,普通番茄与高糖番茄4个时期共有的差异基因有288个,其中下调的有174个,上调的有114个,转色期特有的差异表达基因数量最多。GO分析表明,差异表达基因显著富集在转色期,且富集的GO功能类也最多。KEGG分析表明,转色期富集的差异表达基因及相关通路最多,主要集中在糖、酸代谢等通路。对糖、酸代谢过程关键酶的相关基因进行聚类分析,发现有30个关键差异表达基因。