参薯SPL3蛋白的生物信息学分析及互作蛋白筛选

作     者：刘铭 林方惠 辛立海 宁相洁 韩子如 夏薇 黄小龙 黄东益 吴文嫱 

作者机构：海南大学三亚南繁研究院 海南大学生命健康学院 海南大学热带农林学院 

出 版 物：《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)

年 卷 期：2024年

学科分类：09[农学] 0902[农学-园艺学] 090202[农学-蔬菜学] 

基　　金：国家自然科学基金项目(32160470 32172089)共同资助 

主　　题：参薯 SPL3 酵母双杂交技术 

摘      要：为探究参薯块茎发育相关DaSPL3的下游互作蛋白及调控网络，用生物信息学技术分析DaSPL3蛋白结构和理化性质，用酵母双杂交技术筛选DaSPL3的互作蛋白。通过PCR克隆获得DaSPL3的基因序列，分析其全长为1 179 bp，编码394个氨基酸，蛋白分子量为42.63 kD，理论等电点为6.41，其亲水性平均系数为-0.427，是典型的亲水蛋白。构建pGBKT7:DaSPL3诱饵载体转化至AH109酵母感受态中，对诱饵载体做自激活检测，发现3-AT浓度为10 mmol/L时可抑制其自激活。将pGBKT7:DaSPL3诱饵载体与参薯cDNA文库共转至AH109酵母感受态中做酵母双杂筛库实验，筛选到walls are thin 1 (WAT1)、真核起始因子4A-3 (eIF4A-3)、醛酮还原酶(AKR1)、2-羧基-D-阿拉伯糖醇-1-磷酸酶、叶绿体茎环结合蛋白和叶绿素还原酶共6个互作蛋白。筛库结果为后期探究DaSPL3基因功能及其调控机制提供了研究方向。