鸡马立克氏病病毒pp38基因克隆及生物信息学分析

作     者：林巧儿 周俊 蔡仕楷 杨帆 常传哲 陈玫婷 覃丽梅 

作者机构：佛山科学技术学院生命科学与工程学院 

出 版 物：《特产研究》 (Special Wild Economic Animal and Plant Research)

年 卷 期：2024年

学科分类：090601[农学-基础兽医学] 09[农学] 0906[农学-兽医学] 

基　　金：广东省自然科学基金面上项目(2021A1515012388) 

主　　题：马立克氏病病毒 MDV pp38基因 分子克隆 生物信息学分析 

摘      要：本研究旨在探索鸡马立克氏病病毒(Marek’s disease virus,MDV)编码磷酸化蛋白pp38(Phosphoprotein pp38)的生物信息学特征。通过PCR技术扩增疫苗株CVI988的pp38基因片段,经电泳鉴定后进行测序,并与国内MDV分离株的pp38基因进行同源性比较,使用多种在线软件对该基因编码的蛋白进行生物信息学分析。结果显示,pp38基因扩增产物与预期长度相符,为1006bp;同源性比对表明,CVI988疫苗株pp38基因与参考毒株核苷酸与氨基酸同源性均在99%以上,具有较强的保守性;生物信息学分析显示,该基因编码的pp38蛋白为亲水性蛋白,无信号肽、核定位信号及跨膜区,为非分泌蛋白,其二级结构较稳定,含有7个潜在的抗原决定簇和多个B细胞和T细胞抗原表位。本研究通过生物信息学方法对pp38基因进行分析,发现pp38基因在不同毒力的MDV中相对保守,为深入研究其在MDV致病过程中的作用提供理论依据。