闽楠bZIP基因家族的鉴定与表达分析

作     者：万露露 王中煊 沈军 曹泽宇 陈世品 苏小青 WAN Lulu;WANG Zhongxuan;SHEN Jun;CAO Zeyu;CHEN Shipin;SU Xiaoqing

作者机构：福建农林大学林学院 福建农林大学兰科植物保护与利用国家林业和草原局重点实验室 福建农林大学园艺学院福建福州350002 

出 版 物：《福建农林大学学报（自然科学版）》 (Journal of Fujian Agriculture and Forestry University:Natural Science Edition)

年 卷 期：2024年第53卷第2期

页      面：221-228页

学科分类：0710[理学-生物学] 090701[农学-林木遗传育种] 0907[农学-林学] 07[理学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 

基　　金：福建农林大学林学高峰学科建设项目(72202200205) 福建省林业科技项目(ZMGG-0708) 闽楠良种选育及栽培技术研究课题(118/KJG19008A) 

主　　题：闽楠 bZIP基因家族 全基因组鉴定 水分胁迫 表达分析 

摘      要：【目的】基于闽楠全基因组数据对bZIP(碱性亮氨酸拉链)基因家族进行鉴定,并研究其在闽楠根系水分胁迫下的作用,确定关键调控基因。为进一步探究闽楠根系抵御逆境胁迫的分子机制提供了参考。【方法】利用生物信息学方法进行系统进化、保守基序、基因结构、启动子顺式势作用元件以及蛋白互作分析,并通过qRT-PCR验证基因在水分胁迫下的表达模式。【结果】在闽楠基因组中共鉴定出52个bZIP转录因子,划分为10个亚家族;顺式作用元件分析表明,PbbZIP可能响应光照、生物与非生物胁迫以及生长发育等生物学过程;转录组数据分析显示,PbbZIP15在干旱/水涝胁迫下的表达量较高,PbbZIP40在干旱胁迫下的表达量较高;qRT-PCR验证结果与转录组数据基本一致。【结论】PbbZIP15和PbbZIP40是调控闽楠根系水分胁迫的2个关键基因。