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基于SRAP分子标记构建云南旱冬瓜核心种质

Construction of core collection of Alnus nepalensis in Yunnan based on SRAP molecular markers

作     者:邹广权 王晓丽 曹现富 李艳 张新洛 曹子林 ZOU Guang-quan;WANG Xiao-li;CAO Xian-fu;LI Yan;ZHANG Xin-luo;CAO Zi-lin

作者机构:西南林业大学西南山地森林资源保育与利用教育部重点实验室昆明650224 西南林业大学生态与环境学院昆明650224 

出 版 物:《西南农业学报》 (Southwest China Journal of Agricultural Sciences)

年 卷 期:2024年第37卷第1期

页      面:49-55页

学科分类:090702[农学-森林培育] 0907[农学-林学] 09[农学] 

基  金:国家自然科学基金项目(32260385) 西南山地森林资源保育与利用教育部重点实验室开放基金项目(KLESWFU⁃201905) 

主  题:旱冬瓜 SRAP标记数据 核心种质 

摘      要:【目的】通过对比不同抽样比例构建的旱冬瓜种质子集的有效性和代表性,筛选出旱冬瓜核心种质适宜的构建策略。【方法】以旱冬瓜优树同胞子代为试材,设10%、15%、25%、35%、45%和55%共6个抽样比例,采用Nei’s遗传距离和改进的最小距离逐步取样法取样,采用4个遗传多样性指数分析种质子集对原种质的代表性,通过均值t检验和方差F检验分析种质子集与原种质集变异是否同质,利用相关系数分析种质子集与原种质集的相关性,通过遗传距离比较和聚类分析确认核心种质。【结果】25%抽样比例构建的种质子集的多态位点数、多态位点百分率、观测等位基因数和等位基因保留率与原种质集一致,其余4个评价指数皆显著大于原种质集,均值和方差与原种质的相关系数均接近或者等于1,平均遗传距离较原种质提高16.82%,因此认为在25%抽样比例构建的种质子集能很好地代表原种质。【结论】综合考虑核心种质的有效性、实用性、费用和工作量等,认为25%抽样比例构建的旱冬瓜核心种质能充分代表原种质的遗传多样性。

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