生物信息学分析鉴定循环肿瘤细胞APOH基因作为结直肠癌肝转移核心基因的研究

作     者：郝文德 郭家豪 翟志伟 韩加刚 王振军 Hao Wende;Guo Jiahao;Zhai Zhiwei;Han Jiagang;Wang Zhenjun

作者机构：首都医科大学附属北京朝阳医院普外科北京100020 首都医科大学附属北京妇产医院中心实验室北京100026 

出 版 物：《中国医学前沿杂志（电子版）》 (Chinese Journal of the Frontiers of Medical Science(Electronic Version))

年 卷 期：2024年第16卷第1期

页      面：36-44页

学科分类：1002[医学-临床医学] 100214[医学-肿瘤学] 10[医学] 

主　　题：结直肠癌 肝转移 循环肿瘤细胞 载脂蛋白H 生物信息学分析 

摘      要：目的 循环肿瘤细胞(circulating tumor cells,CTCs)是结直肠癌(colorectal cancer,CRC)肝转移的关键环节,目前对CTCs进行检测和再培养仍存在局限性,迫切需要新的标志物来提高CRC患者血液中CTCs的检出率。方法 经综合生物信息学分析获得由CTCs分泌的在CRC肝转移中起重要作用的血液蛋白,并通过蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络分析和外部高通量基因表达(gene expression omnibus,GEO)数据集对核心基因进行筛选和验证。结果 共鉴定出由CTCs分泌的在CRC肝转移中起重要作用的4个核心基因,其中载脂蛋白H (apolipoprotein H,APOH)最为重要,其在CTCs和肝转移灶中的表达水平显著高于CRC原发灶和其他转移部位,且在血液中CTCs的APOH表达水平显著高于白细胞。受试者操作特征曲线分析显示APOH对CRC肝转移具有较佳的诊断效能。基于APOH预测的EHT1864、Lisitinib和Oxaliplatin可能是CRC患者的潜在治疗药物。结论APOH是由CTCs分泌且在CRC肝转移中起重要作用的核心基因。