基于cytb和rag2基因探讨叶须鱼属分子系统进化关系

作     者：陈鲆 曾如奎 杨德英 哈西 罗文杰 徐丹 刘飞 秦云鑫 熊金鑫 丁文祥 黄俊杰 刘日 唐子婷 何智 严太明 CHEN Ping;ZENG Rukui;YANG Deying;HA Xi;LUOWenjie;XU Dan;LIU Fei;QIN Yunxin;XIONG Jinxiin;DING Wenxiang;HUANG Junjie;LIU Ri;TANG Ziting;HE Zhi;YAN Taiming

作者机构：四川农业大学动物科技学院成都611130 长江上游鱼类资源与环境四川省野外科学观测研究站成都611130 雅砻江流域水电开发有限公司成都610051 

出 版 物：《四川农业大学学报》 (Journal of Sichuan Agricultural University)

年 卷 期：2024年第42卷第1期

页      面：140-148页

学科分类：0710[理学-生物学] 07[理学] 0908[农学-水产] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0901[农学-作物学] 090102[农学-作物遗传育种] 

基　　金：雅砻江流域水电开发有限公司资助(YLGZ-LHDA-ZD2022257) 国家自然科学基金(31972777) 

主　　题：叶须鱼属 cytb基因 rag2基因 系统发育关系 遗传多样性 

摘      要：【目的】探究叶须鱼属的分子系统进化关系,筛选种间鉴定分子标记。【方法】构建叶须鱼属的cytb(5个种)和rag2(修长叶须鱼和裸腹叶须鱼)基因序列的NJ及贝叶斯系统进化树,并结合核苷酸多态位点、单倍型、核酸多态性、遗传距离、遗传分化系数和基因流等,分析种间进化关系和种内遗传多样性。【结果】叶须鱼属每个种的cytb序列单独聚为一支,表明cytb基因序列能将叶须鱼属5个种区分开;种间高度遗传分化(F_(st)0.25),物种之间基因流较弱(Nm1);修长叶须鱼遗传多样性水平最高,锥吻叶须鱼遗传多样性水平最低。基于rag2基因序列的分子系统发育进化树显示,修长叶须鱼和裸腹叶须鱼均单独聚为一支,为独立的种。【结论】cytb和rag2可作为叶须鱼属种间鉴定的分子标记基因,这为叶须鱼属物种的鉴定和系统分类奠定了基础,也为叶须鱼属鱼类保护措施的制定提供了遗传学依据。