蜡蚧刺束梗孢(Akanthomyces lecanii)的线粒体基因组特征与系统发育分析

作     者：常晓云 汪婷 李增智 陈名君 CHANG Xiaoyun;WANG Ting;LI Zengzhi;CHEN Mingjun

作者机构：安徽农业大学安徽省微生物防治重点实验室安徽合肥230036 蚌埠市自然资源和规划局安徽蚌埠233000 浙江泛亚生命科学研究院浙江平湖314200 

出 版 物：《微生物学通报》 (Microbiology China)

年 卷 期：2024年第51卷第8期

页      面：3103-3118页

核心收录：

学科分类：1002[医学-临床医学] 100214[医学-肿瘤学] 10[医学] 

基　　金：安徽省高校优秀青年人才支持计划(gxyqZD2019013) 安徽农业大学研究生创新基金(2020ysj-21) 

主　　题：蜡蚧刺束梗孢 线粒体基因组 虫草科 比较分析 系统发育分析 

摘      要：【背景】蜡蚧刺束梗孢(Akanthomyces lecanii)是重要的生防类虫生真菌,其线粒体基因组详细信息未见报道。【目的】系统研究蜡蚧刺束梗孢线粒体基因组信息,有助于明确该菌准确的系统发育地位,并为虫草科(Cordycipitaceae)真菌物种的系统发育、资源保护和开发利用提供分子依据。【方法】通过对蜡蚧刺束梗孢RCEF6920完整线粒体基因组进行测序,利用生物信息学分析其组成特征、序列重复、系统发育分析、共线性分析,以及与其他虫草科真菌线粒体基因组进行比较。【结果】菌株RCEF6920的环状线粒体基因组全长24577 bp,共编码43个基因,由15个蛋白质编码基因、2个rRNA基因和26个tRNA基因组成。仅鉴定出一个内含子,其阻断rnl基因并鉴定出编码核糖体蛋白S3(rps3)的开放阅读框(open reading frame,ORF)orf447。基因组核苷酸组成存在A+T偏移(72.89%)。26个tRNA基因可转运全部20种氨基酸,并表现为典型的三叶草结构。蛋白质编码基因中频率最高的密码子是AGA,其中精氨酸和亮氨酸出现频率最高,蛋氨酸和色氨酸出现频率最低。蛋白编码基因的系统发育关系显示,刺束梗孢属(Akanthomyces)和萨姆森虫草属(Samsoniella)互为姊妹属。与虫草科其他物种相比,蜡蚧刺束梗孢线粒体基因组较小,除部分虫草属(Cordyceps)物种外,在虫草科物种共线性较好。【结论】本研究获得了蜡蚧刺束梗孢的线粒体基因组全序列及相关信息。蛋白编码基因的系统发育分析支持了蜡蚧刺束梗孢的独立分类地位,也表明虫草科真菌线粒体基因组结构较保守。