基于分子对接与分子动力学模拟探讨生慧颗粒有效成分对γ氨基丁酸A型受体与乙酰胆碱酯酶的作用机制

作     者：李泽飞 王平 LI Zefei;WANG Ping

作者机构：湖北中医药大学基础医学院武汉430065 江汉大学医学部武汉430056 

出 版 物：《中华中医药杂志》 (China Journal of Traditional Chinese Medicine and Pharmacy)

年 卷 期：2024年第39卷第1期

页      面：157-162页

核心收录：

学科分类：1008[医学-中药学(可授医学、理学学位)] 1006[医学-中西医结合] 100602[医学-中西医结合临床] 10[医学] 

基　　金：国家自然科学基金重点项目(No.82130119) 教育部工程研究中心建设项目(No.202234) 

主　　题：生慧颗粒 分子对接 分子动力学模拟 γ氨基丁酸A型受体 乙酰胆碱酯酶 

摘      要：目的:使用分子对接与分子动力学模拟研究生慧颗粒有效成分对γ氨基丁酸A型受体(GABAaR)与乙酰胆碱酯酶(AChE)作用机制。方法:收集生慧颗粒有效成分,使用LibDock将所有成分分别与GABAaR与AChE进行对接并分析作用残基。对最佳结合构象进行30 ns分子动力学模拟,分析结合稳定性及结合能。结果:收集到生慧颗粒有效成分26个。分子对接表明优于地西泮(DZP)成分18个,最优成分为Acteoside。优于多奈哌齐(DNPQ)成分4个,最优成分为PolygalaxanthoneⅢ。分子动力学模拟表明GABAaR与Acteoside可稳定结合,结合能为(-29.60±3.53)kcal/mol。PolygalaxanthoneⅢ在7 ns前与AChE稳定结合,之后脱离结合位点,在27~27.5 ns再次进入结合位点,其结合能在4~6 ns与27~27.5 ns分别为(-14.12±3.03)kcal/mol、(-8.16±2.95)kcal/mol。结论:生慧颗粒治疗失眠和AD的潜在物质基础分别为Acteoside、PolygalaxanthoneⅢ。