基于转录组信息的百合SWEET基因家族鉴定及表达特性分析

作     者：杨成龙 徐小萍 郑益平 郭文杰 方少忠 YANG Chenglong;XU Xiaoping;ZHENG Yiping;GUO Wenjie;FANG Shaozhong

作者机构：福建省农业科学院生物技术研究所福建福州350003 

出 版 物：《北方园艺》 (Northern Horticulture)

年 卷 期：2024年第3期

页      面：50-57页

学科分类：090706[农学-园林植物与观赏园艺] 0907[农学-林学] 09[农学] 

基　　金：福建省属公益类科研院所基本科研专项资助项目(2022R11010021-7) 福建省自然科学基金资助项目(2023J01366) 

主　　题：百合 转录组测序 SWEET家族 

摘      要：以东方百合品种‘西伯利亚’为试材,采用生物信息学方法,研究了百合SWEET基因家族成员编码蛋白的理化性质、二级结构、系统进化、保守结构域、Motif及基因表达模式,对百合SWEET基因家族成员进行鉴定,探究其在鳞茎发育过程中的作用,以期为该类基因生物学功能和百合地下茎生鳞茎发育机制的研究提供参考依据。结果表明:从转录组数据鉴定到了12个SWEET基因,所有家族成员都为稳定的疏水蛋白,且均含有MtN3_slv结构域,可划分为4个亚家族,不同成员在百合茎生鳞茎形成和进一步发育中差异表达。