基于生信分析纳米银对斑马鱼的毒性和机制

作     者：范子怡 宋杰 杨正 冯晨 葛文浩 王慧利 钱秋慧 FAN Zi-yi;SONG Jie;YANG Zheng;FENG Chen;GE Wen-hao;WANG Hui-li;QIAN Qiu-hui

作者机构：苏州科技大学环境科学与工程学院江苏苏州215009 

出 版 物：《中国环境科学》 (China Environmental Science)

年 卷 期：2024年第44卷第2期

页      面：1101-1110页

核心收录：

学科分类：0710[理学-生物学] 083002[工学-环境工程] 0830[工学-环境科学与工程（可授工学、理学、农学学位）] 1002[医学-临床医学] 1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 07[理学] 08[工学] 09[农学] 0903[农学-农业资源与环境] 0805[工学-材料科学与工程（可授工学、理学学位）] 0714[理学-统计学（可授理学、经济学学位）] 0713[理学-生态学] 

基　　金：国家自然科学基金资助项目(32071617) 国家级大学生创新创业训练计划资助项目(202210332030Z) 

主　　题：纳米银 生物信息学 斑马鱼 粒径 表面涂层 

摘      要：依托GEO数据库的GSE50718、GSE61186和GSE89653数据集,从中提取斑马鱼的转录组相关数据,通过生物信息学分析鉴定不同粒径和涂层的纳米银对斑马鱼进行暴露产生的显著差异基因,并比较相关差异基因的数量和上、下调关系.研究发现,斑马鱼的差异表达基因数量按从多到少的排序为:PVP-AgNPs-50nm AgNO_(3) PVP-AgNPs-150nm;Maltose-AgNPs AgNPs.通过GO、KEGG和GSEA富集分析,本研究发现纳米银差异基因主要在免疫相关通路中有显著富集,而硝酸银则主要影响细胞周期及代谢途径.这一发现暗示纳米银与硝酸银在分子层面上的作用机制存在明显的差异.推测纳米银的毒性作用不仅源于释放的银离子,还与其“颗粒特异性紧密相关.此外,纳米银的表面涂层亦对其毒性产生影响.这些发现为纳米银的安全有效应用提供了有益的参考和策略性建议.