基于TCGA数据分析TRIM45基因在乳腺癌中的表达特征及生物学功能

作     者：武永霞 姜良乾 朱峰 WU Yongxia;JIANG Liangqian;ZHU Feng

作者机构：临沂市人民医院产科临沂276000 临沂市人民医院检验科临沂276000 济宁医学院生物科学学院日照276826 

出 版 物：《济宁医学院学报》 (Journal of Jining Medical University)

年 卷 期：2024年第47卷第1期

页      面：15-19页

学科分类：1002[医学-临床医学] 100214[医学-肿瘤学] 10[医学] 

基　　金：山东省医药卫生科技发展计划项目(2019WS123) 山东省自然科学基金(ZR2020QH189) 济宁医学院科研扶持基金(JYFC2019KJ006) 

主　　题：TRIM45 乳腺癌 癌症基因组图谱 生物信息学分析 

摘      要：目的基于GDC TCGA Breast Cancer(BRCA)的数据,评估TRIM45(Tripartite Motif Family 45)在乳腺癌中的表达、预后价值及其与临床病理的相关性,揭示TRIM45在乳腺癌中的生物学功能及可能的作用机制。方法采用R软件对GDC TCGA Breast Cancer(BRCA)数据进行生信分析,研究TRIM45在乳腺癌中的表达及其与临床病理的关系。采用Kaplan-Meier法评估TRIM45对乳腺癌预后的影响。应用KEGG基因集进行GSEA(Gene Set Enrichment Analysis)基因富集分析,采用Spearman相关性分析筛选TRIM45相关作用基因。结果TRIM45在乳腺癌临床样本中的表达高于癌旁组织(P0.001);Kaplan-Meier生存分析显示TRIM45高表达患者的总生存期高于TRIM45低表达者(P0.05);TRIM45在乳腺癌中的表达与T分期、TNM分期、分子分型及病理类型相关联(P0.05);GSEA富集分析结果显示TRIM45在KEGG_PATHWAYS_IN_CANCER信号通路中发挥重要的生物学作用,Spearman相关性分析筛选出TRIM45与STK36、IKBKB、GLI3具有正相关关系(P0.001),与HIF1A具有负相关关系(P0.001)。结论TRIM45在乳腺癌中的表达与T分期、TNM分期、分子分型及病理类型相关联;TRIM45可能通过调控STK36、IKBKB、GLI3和HIF1A在乳腺癌发生发展中发挥重要作用。