3株肺癌细胞中9个肿瘤相关基因的启动子甲基化状态和部分基因表达的相关性
The methylation profiles of the promoter CpG islands of nine tumor associated genes correlate with their expressions in three lung cancer cell lines作者机构:复旦大学附属中山医院上海200032 上海交通大学
出 版 物:《肿瘤》 (Tumor)
年 卷 期:2004年第24卷第3期
页 面:216-222页
核心收录:
学科分类:1002[医学-临床医学] 100214[医学-肿瘤学] 10[医学]
基 金:supported by the National High Technology Research and Development Program of China(863 Program)(2002AA2Z3352) the Scienee Foundation of Shanghai Municipal Government(02DJ14056)to Jingde Zhu as well as the specif fund set up by the State-key Laboratory for Oncogenes and Related Genes,Shanghai Cancer Institute,Shanghai Jiaotong University
主 题:肿瘤相关基因 启动子甲基化 肺癌 甲基化特异性多聚酶链反应法
摘 要:目的 对 3株肺癌细胞中 9个肿瘤相关基因的启动子甲基化状态和部分基因表达的相关性进行评估。方法 通过甲基化特异性多聚酶链反应法 (MSP)结合DNA测序来确定 3株肺腺癌细胞株 (A5 4 9,SH77和SPE A 1)中 9个基因的启动子CpG岛的甲基化状态 :APC ,CDH13,DAPK1,MGMT ,MYOD1,p16 INK4a,p73,RAR β和WT1基因。同时采用半定量RT PCR的方法来量度下列 5个基因的表达 :CDH13,MGMT ,MYOD1,RAR β和WT1基因。结果 在 9个受检基因之中 ,下列 4个基因在三株细胞中均呈同样的甲基化谱式 :仅有去甲基化 :APC和DAPK1,以及兼有甲基化和去甲基化 :p73和p16 INK4a。而其余 5个基因则表现为不同的甲基化模式。尽管 ,这 5个基因的表达谱式大体上符合其启动子CpG岛甲基化的表达静息的原则 ,个别的例外亦是有的。这提示着与DNA甲基化状态无关的机制可能也会参与该基因的表达调控。