大豆叶型性状全基因组关联分析与候选基因鉴定

作     者：王琼 朱宇翔 周密密 张威 张红梅 陈新 陈华涛 崔晓艳 WANG Qiong;ZHU Yu-Xiang;ZHOU Mi-Mi;ZHANG Wei;ZHANG Hong-Mei;CEHN Xin;CEHN Hua-Tao;CUI Xiao-Yan

作者机构：江苏省农业科学院经济作物研究所/江苏省高效园艺作物遗传改良重点实验室江苏南京210014 扬州大学园艺园林学院江苏扬州225009 

出 版 物：《作物学报》 (Acta Agronomica Sinica)

年 卷 期：2024年第50卷第3期

页      面：623-632页

核心收录：

学科分类：09[农学] 0901[农学-作物学] 

基　　金：江苏省基础研究计划(自然科学基金)项目(BK20220740) 江苏省种业振兴揭榜挂帅项目(JBGS057) 江苏省重点研发计划项目(BE2022328) 江苏省农业科技自主创新项目(CX(22)5002)资助 

主　　题：大豆 叶型 异形叶 全基因组关联分析 SNP标记 

摘      要：大豆叶片的形状和垂直分布影响群体冠层结构和光合效率并最终影响大豆的产量。植物叶片大小、形态因着生位置不同而产生差异的现象称为异形叶,虽然异形叶现象在被子植物中广泛存在,但目前关于大豆叶片发育过程中异形叶的调控的研究还很有限。本研究通过对283份大豆种质资源的叶长、叶宽、叶形指数和异形叶指数等叶型相关的性状在江苏南京进行连续2年的考察,利用全基因组关联分析检测到181个叶型性状相关位点,其中能够在2个环境或多个性状中重复检测到的位点18个。利用检测到的与叶型相关的SNP位点,结合基因的表达谱数据、拟南芥中同源基因的功能,鉴定与大豆叶片发育和异形叶形成相关的候选基因。其中在20号染色体的相关位点Chr20:36152820上游发现已知的大豆叶形调控基因Ln(Glyma.20G116200)。此外,在19号染色体的相关位点Chr19:45155943附近鉴定到2个候选基因Glyma.19G192700、Glyma.19G194100,分别被注释为Growth-regulating factor 4(GRF4)和LITTLE ZIPPER 3(ZPR3)基因的同源基因,为阐明大豆异形叶等叶型性状遗传的分子机制奠定了基础。