基于网络药理学与分子对接技术探讨延胡索-鹿衔草药对治疗癌症疼痛的作用机制
Discussion on the mechanism of treating cancer pain with Yanhusuo-Luxiancao based on network pharmacology and molecular docking technology作者机构:黑龙江中医药大学黑龙江哈尔滨150040 黑龙江中医药大学附属第一医院黑龙江哈尔滨150040
出 版 物:《中医临床研究》 (Clinical Journal Of Chinese Medicine)
年 卷 期:2024年第16卷第1期
页 面:9-18页
学科分类:100208[医学-临床检验诊断学] 1002[医学-临床医学] 10[医学]
基 金:黑龙江省自然科学基金面上项目(H201478) 黑龙江省应用技术研究与开发计划项(201903ZDKL010A)
摘 要:目的:基于网络药理学与分子对接技术探讨延胡索-鹿衔草药对治疗癌症疼痛的作用机制。方法:在中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)中分别检索延胡索、鹿衔草的成分及作用靶点,并对照UniPort蛋白数据库进行匹配、校正、筛选,获取药物的最终靶点,并将结果导入Cytoscape3.9.0构建药物-成分-靶点图。分别在GeneCards数据库和OMIM数据库筛选癌症疼痛的靶点。在Venny 2.1.0中,导入药物靶点与疾病靶点,绘制韦恩图,取得交集靶点。再将交集靶点通过STRING网站、Cytoscape3.9.0进行拓扑分析,筛选后构建蛋白质-蛋白质相互作用网络图。基于DAVID数据库、微生信平台对筛选后的核心靶点进行基因本体论(GO)与京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,并绘制作图。最后应用分子对接技术验证核心成分与靶点蛋白的结合能力。结果:通过查找、筛选获取药物成分共56个,其中延胡索49个,鹿衔草7个;药物靶点203个;疾病靶点6020个;交集靶点182个。按照度值获得药物有效成分为槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇等,有效蛋白靶点为丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(Akt Serine/Threonine Kinase 1,AKT1)、肿瘤抑制蛋白p53(Tumor Protein p53,TP53)、Jun原癌基因(Jun Proto-Oncogene,JUN)、肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)、白细胞介素(Interleukin,IL)-6、表皮生长因子受体(Epidermal Growth Factor Receptor,EGFR)等。在GO分析中,生物过程主要参与RNA聚合酶II启动子转录的正调控,转录的正调控(DNA模板),药物反应等240条过程;细胞组分主要参与核、质膜、细胞质等27条;分子功能主要参与结合蛋白、酶结合、相同蛋白结合等48条。KEGG富集分析中,靶点主要涉及癌症通路、磷脂酰肌醇3激酶(Phosphatidylinositol 3-kinase,PI3K)-蛋白激酶B(Akt)信号通路、癌症中的蛋白多糖、肿瘤坏死因子信号通路、丝裂原活化蛋白激酶(Mitogen-Activated Protein Kinase,MAPK)信号通路、人类嗜T淋巴细胞病毒(Human T-lymphotropic Virus,HTLV)感染、缺氧诱导因子(Hypoxia Inducible Factor,HIF)-1信号通路等94条通路。核心靶点蛋白与活性成分的对接验证也均显示有良好的结合性。结论:延胡索-鹿衔草药对是通过多靶点、多通路来干预癌症疼痛的,其主要机制可能与抗炎、调节神经的过程有关,这为临床中中药对癌症疼痛的干预治疗提供了一定的理论依据。