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杨树KT、HAK、KUP基因家族鉴定及钾肥处理对杨树生长的影响

Identification of KT、HAK、KUP gene family in Populus and its effect on growth under potassium fertilizer treatment

作     者:安伟 张玲玲 An Wei;Zhang Lingling

作者机构:西北农林科技大学杨凌712100 

出 版 物:《东北林业大学学报》 (Journal of Northeast Forestry University)

年 卷 期:2024年第52卷第2期

页      面:1-8页

学科分类:0710[理学-生物学] 090701[农学-林木遗传育种] 0907[农学-林学] 07[理学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 

基  金:中央高校基本科研业务费专项资金项目(2452023021) 

主  题:钾转运蛋白 杨树  

摘      要:KT、HAK、KUP基因家族是植物进行K^(+)转运的最大蛋白系统。以毛果杨(Populus trichocarpa Torr.&Gray)全基因组数据为基础,利用生物信息学方法对杨树KT、HAK、KUP家族进行了全基因组鉴定,并在毛果杨全基因组中鉴定出20个KT、HAK、KUP家族成员。理化性质预测分析表明:KT、HAK、KUP基因家族成员均为疏水性蛋白,等电点在5.30~9.16;亚细胞定位预测显示家族成员蛋白集中在细胞质膜上。应用拟南芥和杨树构建系统进化树显示,KT、HAK、KUP基因家族可分为5个亚家族。基因结构及基序(motif)分析表明,KT、HAK、KUP基因进化过程相对保守。顺式作用元件分析表明,KT、HAK、KUP基因家族成员含有诸多与激素、逆境胁迫的响应元件。杨树不同钾离子浓度处理下,植株的净生长情况呈现了显著的差异,说明钾元素对杨树生长影响较大。

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