CD1c作为肝细胞癌复发的潜在生物标志物的鉴定与验证
Identification and validation of CD1c as a potential biomarker for recurrence of hepatocellular carcinoma作者机构:武汉大学中南医院肝胆胰外科湖北武汉430071 天津医科大学总医院肝胆外科天津300052
出 版 物:《武汉大学学报(医学版)》 (Medical Journal of Wuhan University)
年 卷 期:2024年第45卷第2期
页 面:196-201页
学科分类:1002[医学-临床医学] 100214[医学-肿瘤学] 10[医学]
基 金:国家自然科学基金资助项目(编号:82171563 81872029)
摘 要:目的:构建肝细胞癌复发风险模型,并探究CD1c在肝细胞癌复发中作为生物标志物的潜在价值。方法:从公共数据库TCGA中下载肝细胞癌的临床信息和lncRNA的转录组数据,通过差异分析、Lasso回归分析等生物信息学方法,构建预测肝细胞癌复发的风险模型。然后通过模型给患者进行评分,筛选与肝细胞癌复发有关的免疫基因。最后使用免疫荧光染色对筛选的免疫基因进行验证。结果:肝细胞癌患者肿瘤组织与正常组织共有4539个差异表达的lncRNA(P0.05),而复发患者与非复发患者肝肿瘤的差异lncRNA共有697个(P0.05)。二者取交集得到的30个候选lncRNA用于构建预测复发的风险模型。根据风险模型评分公式,将肝细胞癌患者分为高、低复发风险组。在训练组和测试组中,ROC曲线分析显示模型(训练组AUC=0.737,测试组AUC=0.780)相较于其他临床因素具有更好的预测诊断能力。基因集富集分析(GSEA)与基因集变异分析(GSVA)提示肝细胞癌的复发与免疫抑制相关。对风险评分与免疫基因作相关性分析,提示CD1c与肝细胞癌的复发有关(皮尔逊相关系数r=0.291,P0.001)。免疫荧光染色分析进一步验证了CD1c可以作为生物标志物的能力。结论:基于lncRNA构建的复发风险模型具有优秀的预测肝细胞癌复发的能力,筛选出的免疫基因CD1c可作为肝细胞癌复发的潜在生物标志物。