细胞凋亡、坏死和焦亡信号网络关键节点的识别
Identifying key nodes in apoptosis,necroptosis,and pyroptosis signaling networks作者机构:山西大学复杂系统研究所太原030006 山西大学数学科学学院太原030006
出 版 物:《河南师范大学学报(自然科学版)》 (Journal of Henan Normal University(Natural Science Edition))
年 卷 期:2024年第52卷第1期
页 面:51-59页
学科分类:07[理学] 070104[理学-应用数学] 0701[理学-数学]
主 题:细胞死亡 信号网络 中心性指标 k-壳分解 社团发现
摘 要:细胞死亡作为一项基本的生命过程,在生物体的发育、自稳态和病理方面有重要作用.寻找细胞死亡信号通路中的关键节点一直是领域的研究焦点,而信号网络的构建及分析可为其提供重要的理论参考.主要关注凋亡、坏死和焦亡这3种研究最多的细胞死亡方式.首先从已发表文献和生物信息数据库中获取初步数据,对数据进行文本处理,利用处理后的数据构建凋亡、坏死和焦亡的信号网络.然后分别计算各网络的度中心性、介数中心性、接近中心性和特征向量中心性指标,并利用k-壳分解和社团发现方法对节点进行不同的划分.最终综合上述方法所得结果,鉴定出各网络中的关键节点.