香蕉ADA1家族成员鉴定及其在生物和非生物胁迫下的表达分析
Identification of banana ADA1 gene family members and their expression profiles under biotic and abiotic stresses作者机构:福建农林大学园艺植物生物工程研究所福建福州350002
出 版 物:《生物工程学报》 (Chinese Journal of Biotechnology)
年 卷 期:2024年第40卷第1期
页 面:190-210页
核心收录:
学科分类:09[农学] 0902[农学-园艺学] 090201[农学-果树学]
基 金:国家重点研发计划(2019YFD1000901) 国家现代农业产业技术体系(香蕉)专项资金(GARS-31-15) 福建省高原学科建设经费(102/71201801101)
主 题:香蕉 Spt-Ada-Gcn5-乙酰转移酶 激活的改变/缺失亚基1 全基因组鉴定 胁迫
摘 要:Spt-Ada-Gcn5-乙酰转移酶(Spt-Ada-Gcn5-acetyltransferase,SAGA)是高度保守的辅助转录起始复合物,转录接头蛋白-激活的改变/缺失亚基1(alteration/deficiency in activation 1,ADA1),也称作组蛋白H2A功能互作因子1(histone H2A functional interactor 1,HFI1),它是SAGA核心模块中的一个亚基,在植物的生长发育和抗逆性方面发挥着重要的作用。为了解香蕉ADA1的分子特性,本研究基于香蕉基因组数据库,对香蕉ADA1基因家族成员进行鉴定,分析其基本理化性质、系统进化、选择压力、启动子顺式作用元件及生物与非生物胁迫下的表达等。结果显示,香蕉A、B及阿宽蕉基因组中分别有10、6、7个ADA1家族成员;成员均为不稳定的亲水性蛋白,均保守地含有SAGA-Tad1结构域,MaADA1和MbADA1均可与SAGA核心模块中的SAGA相关因子11(SAGA-associated factor 11,Sgf11)互作;系统发育显示香蕉ADA1基因家族成员可划分为3个亚族,进化过程中大多受纯化选择;香蕉ADA1基因家族成员的基因结构差异性较大;香蕉ADA1基因家族成员含有多个响应激素的作用元件;MaADA1-1可能对香蕉在低温胁迫下的抗性起着重要的作用,MaADA1均响应香蕉枯萎病菌胁迫。本研究表明,ADA1基因家族成员在香蕉中高度保守,并可能响应生物与非生物胁迫。