茄子Whirly基因家族鉴定和表达分析

作     者：梁书卿 周晓慧 杨艳 张静娴 刘松瑜 刘军 庄勇 LIANG Shuqing;ZHOU Xiaohui;YANG Yan;ZHANG Jingxian;LIU Songyu;LIU Jun;ZHUANG Yong

作者机构：南京农业大学园艺学院南京210095 江苏省农业科学院蔬菜研究所/江苏省高效园艺作物遗传改良重点实验室南京210014 

出 版 物：《植物遗传资源学报》 (Journal of Plant Genetic Resources)

年 卷 期：2024年第25卷第1期

页      面：120-128页

核心收录：

学科分类：09[农学] 0902[农学-园艺学] 090202[农学-蔬菜学] 

基　　金：江苏省自然科学基金(BK20221429) 江苏省重点研发计划项目(BE2021377) 江苏省农业科技自主创新项目(CX(22)3160) 

主　　题：茄子 Whirly转录因子 生物信息学 表达分析 

摘      要：Whirly是一类能与单链DNA分子结合的植物特异转录因子,在细胞核以及细胞器内都起着广泛且复杂的作用。为探究茄子Whirly基因的功能和进化关系,本研究开展了基因家族成员生物信息学鉴定,包括系统进化关系、基因结构、保守基序及启动子中的顺式作用元件,分析了其在不同组织、外源激素处理和逆境胁迫下表达模式。结果表明,茄子Whirly基因家族包含两个家族成员,分别命名为SmWHY1和SmWHY2,它们与番茄中Whirly基因亲缘关系最近。SmWHY1和SmWHY2在不同组织中均能表达,在叶片中SmWHY1的表达水平高于SmWHY2,在其他组织中SmWHY2的表达水平高于SmWHY1。两个基因的表达均受到脱落酸、茉莉酸甲酯、水杨酸、低温胁迫和病原菌诱导,但不同处理或基因型响应程度存在差异,在抗绵疫病种质G114中能够保持较高的表达水平。以上结果表明SmWHY1和SmWHY2可能在调控茄子生长发育和逆境响应中具有重要作用。