miRNAs-MUC 13调控体系中与仔猪腹泻有关的基因与通路

作     者：路伏增 华卫东 褚晓红 戴丽荷 陈晓宇 章利丰 王志刚 徐如海 LU Fuzeng;HUA Weidong;CHU Xiaohong;DAI Lihe;CHEN Xiaoyu;ZHANG Lifeng;WANG Zhigang;XU Ruhai

作者机构：浙江省农业科学院畜牧兽医研究所浙江杭州310021 

出 版 物：《浙江农业学报》 (Acta Agriculturae Zhejiangensis)

年 卷 期：2023年第35卷第12期

页      面：2785-2793页

学科分类：0905[农学-畜牧学] 09[农学] 

基　　金：浙江省农业新品种选育重大科技专项(2021C02068-4) 国家重点研发计划子任务(2021YFD2000801) 浙江省2021—2023年畜牧产业技术项目(2022R22S60D02) 浙江省基础公益研究计划(LGN22C170009) 

主　　题：Mucin 13 microRNA 仔猪腹泻 基因网络 

摘      要：为研究microRNAs-Mucin 13(miRNAs-MUC 13)调控体系中与仔猪腹泻相关的分子调控机制,对miRNAs-MUC 13调控体系中与仔猪腹泻有关的基因与通路进行了发掘与验证。用NCBI的blastn工具比对了小鼠MUC 13基因和猪基因库中的核酸序列,发现两者的相似性在74%~87%,同源性较高。以小鼠为模型,选择miRDB、mirTarBase、TargetScan数据库预测调控MUC 13基因的miRNA序列,通过StarBase数据库预测这些miRNA序列的靶基因,得到36个靶基因交集。用Cytoscape软件围绕MUC 13和这36个靶基因构建仔猪腹泻基因互作网络,该网络包含19个筛选到的靶基因,基于MCOMD算法分析获得4个分子复合物集团。通过DAVID平台对这4个分子复合物进行基因和通路富集分析,结果发现,靶基因SRF和STAG 2及其参与的有关通路与仔猪腹泻相关。以大肠埃希菌200和仔猪肠上皮细胞系(IPEC-1)作为试验材料,通过体外细胞试验设计仔猪腹泻模型进行验证,实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测结果显示,试验组MUC 13、SRF、IL-6、MAPK、STAG 2、NF-κB、TLR 7等基因的表达量均显著(P0.05)高于对照组,由此推测,SRF与STAG 2基因在miRNAs-MUC 13调控体系中分别通过MAPK、IL6、Toll-like受体信号通路参与仔猪腹泻调控。围绕miRNAs-MUC 13调控体系发掘了4个分子复合物集团和2个核心基因(SRF和STAG 2)并进行了试验验证,这为靶向治疗仔猪腹泻提供了理论参考和科学依据。