肿瘤相关基因ADAM15在结肠癌中一个非同义变异对细胞黏附及侵袭的影响
A nonsynonymous single nucleotide variant of the tumor-related gene ADAM15 in colon cancer and its impact on cell adhesion phenotype作者机构:首都医科大学基础医学院医学遗传学与发育生物学学系北京100069 北京市十一学校北京100039
出 版 物:《首都医科大学学报》 (Journal of Capital Medical University)
年 卷 期:2023年第44卷第6期
页 面:1044-1052页
学科分类:1002[医学-临床医学] 10[医学] 100206[医学-皮肤病与性病学]
主 题:结肠癌 ADAM15基因 细胞黏附 单核苷酸变异 肿瘤微环境
摘 要:目的解析ADAM15基因单核苷酸变异(single nucleotide variant,SNV)在结肠癌肿瘤发生发展相关的细胞学过程中的具体功能作用。方法首先对具有侵袭表型的结肠癌患者癌组织及癌旁组织全外显子组测序,然后进行野生型/突变型ADAM15结肠癌HCT-8细胞系细胞功能实验,进而完成野生型/突变型ADAM15细胞系的转录组测序分析。结果采用全外显子组测序在预后不良的患者中检出ADAM15基因SNV rs6427128,提示可能影响结肠癌的进展。细胞功能实验显示,rs6427128损失了ADAM15所具有的上调细胞侵袭能力的作用,而使细胞黏附能力增加约26%。转录组测序分析显示,与野生型相比,rs6427128过表达细胞的差异表达基因富集在细胞黏附、DNA的复制与转录、炎症反应等多种细胞生物学过程,提示rs6427128变异可能通过促进肿瘤细胞的黏附参与调节肿瘤微环境的重塑,从而影响结肠癌的进展。结论结合适当的细胞模型和较为精细的分析方法,深入解析临床样本中所检出的一些高频非同义潜在功能性变异体,可以为肿瘤相关基因的结构功能关系提供有益的提示性实验室数据。