紫花苜蓿CNGC基因家族成员鉴定及分析

作     者：李小红 王晓彤 麻旭霞 蔡文祺 冯学丽 马梦凡 李淑霞 

作者机构：宁夏草牧业工程技术研究中心 农业农村部饲草高效生产模式创新重点实验室 宁夏大学林业与草业学院 

出 版 物：《草地学报》 (Acta Agrestia Sinica)

年 卷 期：2023年

核心收录：

学科分类：090503[农学-草业科学] 0905[农学-畜牧学] 09[农学] 

基　　金：国家自然科学基金项目（32101426） 宁夏自然科学基金项目（2023AAC05019）资助 

主　　题：紫花苜蓿 CNGC基因家族 全基因组 系统进化 基因结构 非生物胁迫 

摘      要：环核苷酸门控通道（CNGC）基因家族作为非选择性阳离子通道基因家族之一，在植物信号转导、生长发育和环境胁迫等生理过程中发挥着重要作用。本研究利用生物信息学手段和转录组数据对紫花苜蓿CNGC家族成员的进化关系、基因结构、保守基序、顺式作用元件、染色体定位、共线性关系以及基因表达进行分析。结果表明，紫花苜蓿MsCNGC基因家族成员有16个，在染色体上不均匀分布，存在片段重复，大多数蛋白定位于细胞质膜。系统发育树将MsCNGCs为4个亚家族。基因结构和保守基序分析表明，都含有cNMP/CNBD和ITP功能域。顺式作用元件分析表明不同MsCNGCs基因含有许多与非生物或生物胁迫和激素响应元件。MsCNGC4和MsCNGC7.2蛋白之间存在互作。MsCNGC基因具有组织表达特异性。MsCNGC基因对干旱、盐和激素等非生物胁迫均有显著的响应，为进一步研究MsCNGC基因在调控非生物胁迫过程中的潜在功能提供了理论依据。