基于转录组信息的杜梨盐胁迫相关MYB转录因子鉴定与分析
Identification and Analysis of MYB Transcription Factors Related to Salt Stress in Pyrus betulaefolia based on Transcriptome Information作者机构：江苏省农业科学院果树研究所/江苏省高效园艺作物遗传改良重点实验室 南京林业大学生物与环境学院
出 版 物：《农业生物技术学报》 (Journal of Agricultural Biotechnology)
年 卷 期：2024年第32卷第1期
页 面：132-146页
核心收录：
学科分类：09[农学] 0902[农学-园艺学] 090201[农学-果树学]
基 金：国家自然科学基金面上项目(31772287) 江苏省自然科学基金(BK20191238) 江苏省种业振兴揭榜挂帅项目【JBGS084】 江苏现代农业产业技术体系建设项目【JATS438】
摘 要：MYB(myeloblastosis)蛋白是植物中最大的转录因子家族之一，广泛参与植物逆境胁迫应答。到目前为止，对于同一物种不同耐盐能力生态型之间MYB家族的表达模式还没有系统的比较分析。本研究基于杜梨(Pyrus betulaefolia)耐盐单株和普通单株转录组测序(RNA-sequencing, RNA-Seq)数据，筛选鉴定杜梨盐胁迫前后差异表达MYB基因，进行保守结构域归类、染色体分布分析、亚细胞定位预测和系统进化树构建，检测盐胁迫后PbMYBs基因在杜梨不同耐盐性株系各器官中的表达情况。借助转录组分析工具，注释获得129个盐胁迫后差异表达的杜梨PbMYBs基因，根据其结构特性可分为3大类：1RMYB、R2R3-MYB和3R-MYB。杜梨15号染色体上分布的PbMYBs基因数目最多。构建系统进化树发现，杜梨MYB家族包括3个大类、23个亚类。亚细胞定位预测结果显示，42个PbMYBs转录因子定位于胞外，87个定位于细胞核中。基于转录组数据的基因表达模式分析表明，杜梨PbMYBs基因参与了不同器官应对盐胁迫的转录调控；荧光定量PCR证实，不同PbMYBs转录因子基因分别在杜梨根、茎或叶中受盐胁迫信号诱导表达水平上调或下调。上述结果为进一步研究杜梨MYB家族的基因结构和生物学功能提供相关资料。
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