青海云杉响应锈菌侵染转录组分析

作     者：李海兰 白露超 LI Hailan;BAI Luchao

作者机构：青海大学农牧学院西宁810016 

出 版 物：《干旱区资源与环境》 (Journal of Arid Land Resources and Environment)

年 卷 期：2023年第37卷第11期

页      面：140-149页

核心收录：

学科分类：09[农学] 0904[农学-植物保护] 

基　　金：青海省科技成果转化专项(2023-SF-119)资助。 

主　　题：青海云杉 锈菌 转录组 互作 

摘      要：为探究锈菌与青海云杉之间的互作机制,利用Illumina测序平台对青海云杉健康植株和发病植株进行转录组测序,以差异倍数(FC)≥2且错误发现率(FDR)0.01为标准,共获得15408个差异表达基因,有10296个差异基因上调,5112个差异基因下调。GO注释中,DEGs显著富集到代谢过程、细胞过程、催化活性和结合等过程。KEGG注释中,DEGs显著富集到核糖体、植物与病原互作、内质网蛋白加工、信号转导等过程,通过分析相关通路发现,青海云杉响应锈菌侵染的分子机制受多基因网络系统的调控。为验证RNA-seq数据的可靠性,对10个DEGs进行RT-qPCR表达量检测,验证结果为,RT-qPCR和RNA-seq测得的基因表达趋势基本一致。这有助于深入研究候选基因在青海云杉响应锈菌侵染中的作用,同时也为开展青海云杉抗病功能基因组学研究奠定基础。