新基因FAM92A1的生物信息学分析及功能预测

作     者：佘高明 聂偲 张同园 李聪 刘炜 阮绪芝 SHE Gao-ming;NIE Si;ZHANG Tong-yuan;LI Cong;LIU Wei;RUAN Xu-zhi

作者机构：郧阳医学院附属太和医院生命科学研究所湖北十堰442000 

出 版 物：《郧阳医学院学报》 (Journal of Yunyang Medical College)

年 卷 期：2008年第27卷第4期

页      面：289-294页

学科分类：0710[理学-生物学] 07[理学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0901[农学-作物学] 090102[农学-作物遗传育种] 

基　　金：湖北省自然科学基金[NO:2007ABA189] 郧阳医学院学生科研基金[NO:2007XS03]~~ 

主　　题：FAM92A1 生物信息学 DUF1208结构域 

摘      要：目的:运用生物信息学方法对新基因FAM92A1功能进行预测分析,为进一步深入研究FAM92A1功能奠定基础。方法:利用多种生物信息学分析软件,分析FAM92A1基因的表达谱、保守性及其编码蛋白的结构和定位等特征,根据结构预测其功能。结果:该基因表达广泛,高度保守,有多个选择性剪接变异体。编码蛋白属于DUF1208保守结构域家族,与猩猩、小鼠、大鼠、鸟、非洲爪蟾、斑马鱼和果蝇的相似性分别为91%、84%、82%、74%、67%、65%、26%。它含有一个卷曲螺旋结构和多个磷酸化位点,无信号肽及跨膜结构。亚细胞定位预测其定位于细胞核。结论:利用生物信息学方法可初步预测FAM92A1为一细胞核内具有调节作用的蛋白质,其在细胞增殖和分化的精确调控方面可能起着重要作用。