龙眼DlFNS蛋白的生物信息学分析

作     者：张泽宇 朱明喜 陈昊泽 刘明源 张紫微 郑威 Zhang Zeyu;Zhu Mingxi;Chen Haoze;Liu Mingyuan;Zhang Ziwei;Zheng Wei

作者机构：哈尔滨商业大学英才学院哈尔滨150076 哈尔滨商业大学药学院哈尔滨150076 

出 版 物：《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)

年 卷 期：2024年第22卷第1期

页      面：61-67页

学科分类：09[农学] 0902[农学-园艺学] 090201[农学-果树学] 

基　　金：国家级大学生创新创业训练计划项目(202010240022)资助 

主　　题：龙眼 DlFNS 生物信息学分析 

摘      要：为了深入分析龙眼DlFNS蛋白的结构及其生物学功能,本研究从龙眼转录组数据(SRA accession:SRP155595)中筛选和鉴定出一个DlFNS基因,并运用生物信息学方法对其进行分析。结果表明,DlFNS蛋白序列中含有530个氨基酸,分子式为C_(2731)H_(4353)N_(735)O_(764)S_(21),具有跨膜结构但不含信号肽,是亲水蛋白,主要定位在内质网中。二级结构预测结果显示,无规则卷曲和α-螺旋是DlFNS蛋白中主要的二级结构元件。利用SWISS-MODEL构建三级结构模型,并利用Ramachandran评估三级结构模型,结果表明构建的三级结构模型可靠。FNS蛋白的系统进化树分析表明DlFNS蛋白与阿月浑子FNS蛋白亲缘关系最近。本研究结果将为进一步研究龙眼DlFNS基因的功能及其在龙眼类黄酮合成中的分子调控机制提供理论依据。