甘菊ClKRPs转录因子的鉴定及分子生物学分析

作     者：杨雯婷 张佳凝 何子涵 任镘蓉 全英杰 高日 赵丽 Yang Wenting;Zhang Jianing;He Zihan;Ren Manrong;Quan Yingjie;Gao Ri;Zhao Li

作者机构：延边大学农学院延吉133400 延边林业科学研究院延吉133002 

出 版 物：《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)

年 卷 期：2024年第22卷第1期

页      面：1-7页

学科分类：090706[农学-园林植物与观赏园艺] 0907[农学-林学] 09[农学] 

基　　金：国家自然科学基金项目(32060696) 延边州科技发展计划项目(2020FG31) 延边大学校企合作项目(延大科合字2020) 延边大学青年基金项目(延大科合字第21号) 延边大学博士科研启动基金项目(2018) 农业农村部景观设计重点实验室开放课题(KF201902)共同资助 

主　　题：甘菊(Chrysanthemum lavandulifolium) ClKRPs 系统进化树 理化性质 

摘      要：甘菊[Chrysanthemum lavandulifolium(*** Trautv.) Ling et Shih]为菊科菊属植物,二倍体,基因组较小,为栽培菊花的亲本之一。KRP是植物中独特的转录因子,参与细胞周期调控,影响植物生长和发育。本试验以甘菊为材料,克隆ClKRPs基因,分析其基本理化性质、构建系统进化树、miRNA靶基因预测、保守基序分析。结果表明,ClKRPs转录因子相对分子量为29.10~144.30,ClKRPs蛋白都为酸性蛋白;ClKRP1、ClKRP2、ClKRP3、ClKRP5、ClKRP6、ClKRP10、ClKRP12、ClKRP14、ClKRP15蛋白为稳定蛋白,ClKRP4、ClKRP7、ClKRP8、ClKRP9、ClKRP11、ClKRP13、ClKRP16为不稳定蛋白。系统发育分析显示,甘菊ClKRPs蛋白可以分为两大类。利用MEME软件识别出6个甘菊ClKRP保守基序。生物信息学分析预测5个ClKRP基因与4个miRNA结合。本研究为进一步探索和分析甘菊ClKRPs转录因子的功能奠定了基础。