药敏试验与比较基因组揭示嗜水气单胞菌耐药潜力
Drug sensitivity test and comparative genome revealed the drug resistance potential of Aeromonas hydrophila作者机构：上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心上海201306 上海海洋大学国家水生动物病原库上海201306 上海海洋大学农业农村部淡水水产种质资源重点实验室上海201306
出 版 物：《上海海洋大学学报》 (Journal of Shanghai Ocean University)
年 卷 期：2023年第32卷第6期
页 面：1216-1223页
核心收录：
基 金：国家重点研发计划“蓝色粮仓科技创新”专项课题(2019YFD0900102) 国家淡水水产种质资源库项目(FGRC:18537)
主 题：嗜水气单胞菌 药敏试验 全基因组测序 比较基因组 系统发育 耐药基因
摘 要：为了揭示嗜水气单胞菌的耐药潜力,运用微量肉汤稀释法和比较基因组学方法对其进行了分析。结果显示:恩诺沙星、硫酸新霉素、氟苯尼考、盐酸多西环素对3株菌株有抑制作用,而磺胺间甲氧嘧啶对3株菌株均无抑制作用。菌株的耐药表型未与耐药基因一一对应,某些菌株虽然未注释到耐药基因,也可以表现出相关耐药表型;自测的3株菌株基因组大小差异较大,亲缘关系非近缘,但耐药基因数量基本一致;经ANI(平均核苷酸一致性)计算后,基因组比较分析发现嗜水气单胞菌基因组具有较强的可变性,即使是近缘菌株,其基因组间仍有较大差异;系统发育分析显示,不同宿主来源的菌株在进化树上呈现分散分布,近缘菌株分布在不同国家和地区;所有菌株在CARD(综合抗生素耐药性数据库)中共注释到21种耐药基因,其中7种耐药基因为所有菌株共享。造成这一现象的原因,很可能是由于嗜水气单胞菌基因组较强的可变性以及其宿主分布的广泛性,菌株间进行频繁的基因交流,促进了耐药基因在整个物种的快速扩散,所以即使菌株间基因组变化较大,但耐药基因在菌株间的变化较小。
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