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2020-2021年云南蔬菜产区番茄斑驳花叶病毒的发生及其豌豆分离物全基因组序列分析

Occurrence of tomato mottle mosaic virus in Yunnan vegetable production ereas during 2020-2021 and complete genome amplification and sequence analysis of a ToMMV pea isolate

作     者:张舒 张天毅 陈泓霖 谭冠林 李凡 ZHANG Shu;ZHANG Tianyi;CHEN Honglin;TAN Guanlin;LI Fan

作者机构:云南农业大学植物保护学院昆明650201 云南农业大学现代教育技术中心昆明650201 

出 版 物:《植物病理学报》 (Acta Phytopathologica Sinica)

年 卷 期:2023年第53卷第5期

页      面:819-830页

核心收录:

学科分类:09[农学] 0904[农学-植物保护] 090401[农学-植物病理学] 

基  金:国家自然科学基金(31660039) 云南省院士专家工作站(202005AF150040) 

主  题:番茄斑驳花叶病毒 发生 豌豆 基因组序列 

摘      要:云南是国内首个发现番茄斑驳花叶病毒(tomato mottle mosaic virus, ToMMV)的省份之一。自2013年在元谋县的辣椒上发现ToMMV以来,截至目前已在云南省多个地区的辣椒和番茄上发现了ToMMV的侵染。为明确2020-2021年间ToMMV在云南省的发生分布情况,对云南省7个州市蔬菜产区的田间植物样品进行了ToMMV的分子检测。发现ToMMV仅在楚雄州元谋县的番茄、红河州蒙自市和昆明市晋宁区的豌豆上零星发生。其中,2020年ToMMV的检出率为1.79%,2021年为1.41%。豌豆是继茄科作物外新发现的ToMMV自然新寄主,染病豌豆顶端叶片黄化,伴有轻微花叶和皱缩。利用RT-PCR及RACE技术获得了ToMMV豌豆分离物(GenBank登录号:ON146334)全基因组序列6 400 nt,其与国内外已报道的ToMMV分离物核苷酸序列一致性在98.53%~99.95%之间,这是首例从非茄科植物上分离出来的ToMMV全基因组序列,研究结果有助于进一步了解该病毒种群的遗传进化关系。本文的结果也表明,无论是来自茄科寄主还是非茄科寄主,当前国内外发现的ToMMV的遗传变异不大,可能有共同的起源。

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