中华猕猴桃全基因组MADS-box基因家族鉴定及表达分析

作     者：高欢 郑珂昕 廖光联 王海令 陈璐 贾东峰 黄春辉 曲雪艳 徐小彪 GAO Huan;ZHENG Kexin;LIAO Guanglian;WANG Hailing;CHEN Lu;JIA Dongfeng;HUANG Chunhui;QU Xueyan;XU Xiaobiao

作者机构：江西农业大学农学院南昌330045 江西农业大学猕猴桃研究所南昌330045 

出 版 物：《果树学报》 (Journal of Fruit Science)

年 卷 期：2023年第40卷第11期

页      面：2307-2324页

核心收录：

学科分类：09[农学] 0902[农学-园艺学] 090201[农学-果树学] 

基　　金：国家自然科学基金项目(32160692)。 

主　　题：中华猕猴桃 MADS-box 光响应 顺式元件 生长发育 

摘      要：【目的】鉴定并分析中华猕猴桃MADS-box基因家族成员,探明MADS-box基因家族成员在果实生长发育及芽休眠中的表达模式。【方法】基于中华猕猴桃红阳V3基因组数据库,利用生物信息学方法对中华猕猴桃MADS-box全基因组进行鉴定,分析其家族成员的理化性质、系统进化树、保守基序、顺式作用元件,并对其在果实生长发育及不同组织中的表达模式进行分析。【结果】在中华猕猴桃红阳基因组中鉴定到了68个AcMADS-box基因,共包含11个亚家族,不均匀地分布于22条染色体上,成员间共存在32对共线性基因对;在基因家族上游启动子区域发现与光响应、激素响应、逆境胁迫响应等相关的顺式元件;17个AcMADS-box基因在组织间高表达且有表达特异性,推测是参与调控中华猕猴桃生长发育的关键基因。【结论】初步鉴定并提供了AcMADS-box家族成员信息,16个AcMADS-box家族成员在根、枝、茎、叶、花中高表达,8个家族成员在花芽中高表达。结果为进一步研究AcMADS-box参与中华猕猴桃的生长发育调控机制提供参考。