基于全基因组信息的山药MYB转录因子家族分析

作     者：张强 王耀琴 郭淑红 王秋宝 左宪强 田洪岭 

作者机构：山西农业大学经济作物研究所 

出 版 物：《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)

年 卷 期：2023年

学科分类：0710[理学-生物学] 07[理学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0902[农学-园艺学] 090202[农学-蔬菜学] 

基　　金：山西省博士毕业生、博士后研究人员来晋工作奖励(SXBYKY2022109) 吕梁市引进高层次科技人才重点研发项目(2022RC25) 山药种质资源圃建设及高黏液蛋白新品种选育(yzgc055)共同资助 

主　　题：山药 MYB家族 结构分析 系统进化 

摘      要：MYB家族已在多种生物代谢调控中起正向作用，是生物中最关键的家族之一。为了分析山药MYB转录因子家族，本研究基于山药全基因组数据，使用可视化软件MEGA 7.0、TBtools和R语言，同时结合在线生物信息网站ExPASy、SWISS-MODEL和SOPMA等预测分析山药MYB家族蛋白理化性质、高级结构、保守基序，并对其系统进化情况进行分析。结果表明，共筛选到66个山药MYB家族成员，氨基酸范围197～1 232 aa，分子量大小22.51～133.99 kD，等电点(pI)为4.59～9.82，属于亲水性蛋白，均在细胞核表达，均不含信号肽，均无跨膜结构特征；染色体定位发现成员在染色体5号上分布最多；系统进化分析结果表明，将其聚类为10个亚族，可通过山药与拟南芥MYB转录因子家族蛋白序列同源性关系预测山药MYB转录因子家族的次生代谢物调节、逆境胁迫和次生壁形成等功能。本研究为山药MYB转录因子家族生物学功能的研究提供科学依据。