桤木Genomic-SSR与EST-SSR分子标记的差异分析

作     者：王泽亮 杨勇智 杜晋城 陈炙 黄振 郭洪英 WANG Zeliang;YANG Yongzhi;DU Jincheng;CHEN Zhi;HUANG Zhen;GUO Hongying

作者机构：四川省林业科学研究院四川成都610081 四川省草原科学研究院四川成都611731 

出 版 物：《四川林业科技》 (Journal of Sichuan Forestry Science and Technology)

年 卷 期：2023年第44卷第4期

页      面：36-42页

学科分类：08[工学] 0829[工学-林业工程] 

基　　金：世界银行贷款长江流域上游森林生态系统恢复项目(2019-510000-02-01-400761) 四川省科技计划项目(2021YFYZ0032)。 

主　　题：桤木 简单序列重复 遗传多样性 多倍体 GenoDive 

摘      要：桤木(Alnus cremastogyne)为非豆科固氮树种,也是我国最重要的一个桤木属特有种,具有重要的生态功能。本文分析了桤木基因组SSR与EST-SSR两种来源标记的遗传差异,结果显示EST-SSR的平均等位基因数与平均有效等位基因数高于Genomic-SSR,而对平均观察杂合度与平均期望杂合度来说,Genomic-SSR高于EST-SSR,聚类分析显示Genomic-SSR与EST-SSR在小的分群上有差异,说明Genomic-SSR与ESTSSR标记在解析遗传多样性与遗传关系方面有一定差异,综合两种标记可以获得更加客观的结果。