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砂糖橘和砂糖灯笼橘性状差异的转录组分析

Transcriptome analysis based on the characteristic difference between Shatang tangerine and Shatang Lantern tangerine

作     者:唐娟 望飞勇 张兰 TANG Juan;WANG Feiyong;ZHANG Lan

作者机构:广西壮族自治区农业科学院南宁530007 

出 版 物:《果树学报》 (Journal of Fruit Science)

年 卷 期:2023年第40卷第9期

页      面:1811-1822页

核心收录:

学科分类:09[农学] 0902[农学-园艺学] 090201[农学-果树学] 

基  金:广西壮族自治区科技基地与人才专项(桂科AD20325012)。 

主  题:砂糖灯笼橘 砂糖橘 性状 转录组 蜡质 

摘      要:【目的】通过比较砂糖橘和砂糖灯笼橘性状差异及利用转录组测序数据,筛选砂糖橘和砂糖灯笼橘叶、果肉、橘络、橘皮之间的差异基因,探究砂糖橘自然变异品种砂糖灯笼橘橘皮、叶中与蜡质生物合成相关的显著差异基因。【方法】分别取同一生长时期的砂糖灯笼橘和砂糖橘进行观察记录,取叶、果肉、橘络、橘皮4个组织样本,液氮速冻,设立3个生物学重复进行转录组测序。分析2个物种间的转录组测序结果,寻找关键差异基因。【结果】通过砂糖灯笼橘与砂糖橘对比,砂糖灯笼橘叶较大、卷曲,边缘性状不规则;果实偏大,果皮表面布满沟壑,存在较多点状突起,同时叶和果皮部位存在蜡质缺失。砂糖灯笼橘叶存在差异基因数量最多,其次为果肉、皮、橘络,差异基因主要参与的功能为蛋白结合、分子结合、ATP结合。砂糖灯笼橘叶、果皮分别存在12个、9个与蜡质生物合成相关的显著差异基因,其中包含5个相同的下调基因,为CER1、CER3、HHT、P45086A8、P45086A22,这些基因极有可能是导致砂糖灯笼橘表面蜡质排布不均的关键基因。【结论】砂糖橘与砂糖灯笼橘性状差异明显,转录组数据显示叶的差异基因数量最多,其中叶和果皮中存在5个表达趋势一致的相同蜡质合成基因,可能是导致砂糖灯笼橘表面蜡质缺失的关键基因。

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