水稻CNGCs家族的鉴定及非生物胁迫诱导表达模式分析
Identification of CNGCs Gene Family in Rice and Its Expression Pattern Analysis Induced by Abiotic Stresses作者机构:湖北大学生命科学学院省部共建生物催化与酶工程国家重点实验室武汉430062
出 版 物:《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)
年 卷 期:2023年第21卷第20期
页 面:6625-6637页
基 金:湖北省技术创新专项重大项目(2018ABA080 2020BBB052) 湖北省自然科学基金重点项目(2019CFA027)和湖北省自然科学基金项目(2020CFB261)共同资助
主 题:水稻 环核苷酸门控离子通道 生物信息学 非生物胁迫 表达模式分析
摘 要:为了解水稻CNGCs家族成员的基因结构、进化特征、亚细胞定位、启动子顺式作用元件和生物学功能,本研究利用生物信息学的手段对水稻CNGCs家族进行鉴定,运用RT-qPCR的方法分析OsCNGCs在非生物胁迫下的诱导表达模式。结果表明,水稻共有16个CNGCs,分布在1、2、3、4、5、6、9和12号染色体上。进化树分析显示OsCNGCs可分为4个大组(Ⅰ,Ⅱ,Ⅲ和Ⅳ),而Ⅳ组可以细分为Ⅳ-A和Ⅳ-B 2个亚组。OsCNGCs启动子区域存在多种顺式调控元件,包括各种类型的光响应元件、厌氧诱导响应元件、逆境相关转录因子结合元件、防御和逆境响应元件、低温响应元件以及各种植物激素响应元件等,暗示OsCNGCs在响应多种激素和非生物胁迫中可能存在重要调控作用。多种非生物胁迫诱导表达分析表明,大多数OsCNGCs基因表现出明显的差异表达。本研究为解析CNGCs家族基因在水稻应对非生物胁迫中的功能提供了参考。