lncRNA HOTAIR作为肺鳞癌预后标记物的生物信息学研究

作     者：殷国泉 吕坤 YIN Guoquan;LÜKun

作者机构：皖南医学院第一附属医院弋矶山医院中心实验室安徽芜湖241001 皖南医学院第一附属医院弋矶山医院检验科安徽芜湖241001 

出 版 物：《皖南医学院学报》 (Journal of Wannan Medical College)

年 卷 期：2023年第42卷第5期

页      面：419-422,435页

学科分类：1002[医学-临床医学] 100214[医学-肿瘤学] 10[医学] 

基　　金：安徽高校研究生科学研究项目(YJS20210546) 

主　　题：肺鳞癌 长链非编码RNA HOTAIR 生物信息学 

摘      要：目的:通过生物信息学分析确定长链非编码RNA HOTAIR(HOTAIR)作为肺鳞癌(LUSC)预后生物标记基因。方法:利用癌症基因组图谱(TCGA)数据库分析HOTAIR在泛癌中的表达情况,根据中位数将数据分为高、低表达HOTAIR组,采用Kaplan-Meier法对两组患者进行生存分析并绘制生存曲线、利用linkedOmics数据库分析HOTAIR在LUSC中的临床特征关系及其共表达基因,利用TIMER软件验证不同HOTAIR mRNA表达水平与LUSC患者免疫细胞浸润的相关性,通过绘制受试者工作特征(ROC)曲线评估模型的准确性。结果:HOTAIR在多种类型癌症中表达较高,在配对及非配对LUSC样本中,HOTAIR在肿瘤患者的表达均高于正常患者。ROC分析HOTAIR可作为LUSC的潜在的生物标志物,ROC曲线下面积(AUC)=0.883;HOTAIR的表达与病理阶段显著相关(P0.05);HOTAIR与LUSC患者的总体生存率(OS)、疾病特异性生存期(DSS)、无进展生存期(PFI)相关性无统计学意义;HOTAIR共表达的基因富集在多种免疫反应生物过程中。结论:HOTAIR在LUSC中表达上调,并且与不良生存预后显著相关,可作为LUSC的生物标记物和潜在的治疗靶点。