糖尿病性心肌病小鼠心肌线粒体circRNA表达谱与功能富集分析

作     者：王毅 尤红俊 韩稳琦 刁佳宇 WANG Yi;YOU Hongjun;HAN Wenqi;DIAO Jiayu

作者机构：陕西省人民医院心内二科陕西西安710051 

出 版 物：《西安交通大学学报（医学版）》 (Journal of Xi’an Jiaotong University（Medical Sciences）)

年 卷 期：2023年第44卷第5期

页      面：701-708页

核心收录：

学科分类：1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 10[医学] 

基　　金：陕西省人民医院科技人才支持计划项目(2021BJ-27)。 

主　　题：糖尿病性心肌病 线粒体 circRNA 

摘      要：目的探索糖尿病性心肌病(diabetic cardiomyopathy,DCM)小鼠心肌线粒体circRNA的差异表达情况及其功能分析。方法以16周龄的db/db小鼠构建DCM小鼠模型,C57BL/KsJ小鼠作为对照。提取两组小鼠心肌组织RNA,高通量测序筛选两组差异表达的线粒体circRNA,使用RT-qPCR对差异表达显著的前10个circRNA验证测序结果,并对差异表达circRNA靶基因作功能富集分析,使用miRNA靶标预测软件对circRNA-miRNA共表达网络分析。结果与对照组比较,DCM组小鼠心肌中147个差异表达的线粒体circRNA,其中高表达89个、低表达58个。差异表达circRNA在组织中的表达变化与测序结果趋势一致。GO与KEGG富集分析显示,差异表达的circRNA靶基因主要富集在cGMP/PKG、胰高血糖素等通路,与线粒体能量代谢、心肌肥大相关。circRNA-miRNA共表达网络分析发现,表达上调最显著的chrM:1207-1536+与miR-491-3p、miR-99a-3p、miR-99b-3p有关联,表达下调最显著的chrM:1453-3205+与miR-181b-1-3p、miR-181b-2-3p、miR-672-5p有关联。结论DCM小鼠心肌线粒体存在差异表达的circRNA,且可能与相应miRNA相互作用,通过调节能量代谢、凋亡等通路影响心肌纤维化、心肌细胞肥大,从而参与DCM的发病。