沙棘MADS-box基因家族鉴定及分析

作     者：李鸿燕 李嘉欣 刘丽娥 李昕娟 周武 

作者机构：青海大学生态环境工程学院 

出 版 物：《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)

年 卷 期：2023年

学科分类：08[工学] 0829[工学-林业工程] 

基　　金：国家自然科学基金地区科学基金项目(32160386) 青海省科技厅自然科学基金项目(2019-ZJ-966Q)共同资助 

主　　题：MADS-box 沙棘 基因家族 生物信息 

摘      要：MADS-box基因是真核生物中一类参与生长发育的重要转录因子，具有广泛的生物学功能。为深入了解沙棘MADS-box基因家族的生物学特性，本研究利用生物信息学方法对沙棘MADS-box基因家族进行鉴定分析。结果表明，从沙棘中鉴定出30个MADS-box基因家族成员，根据蛋白质序列可将30个MADS-box基因分为10个亚类，不均匀分布于12条染色体上。共线性分析发现沙棘种内具有6对片段复制基因，沙棘与拟南芥的种间分析发现8对片段复制基因，推测MADS-box基因家族主要由片段复制而来。沙棘MADS-box基因内含子密度差异较大，且具有广泛的响应元件，其中光响应元件数目相对较多。沙棘30个MADS-box基因在不同组织中的表达量具有差异性，说明MADS-box基因具有不同的组织特异性表达模式。沙棘MADS-box蛋白质与植物开花时间密切相关，可能为植物成花发育的关键蛋白。本研究为进一步探讨MADS-box基因家族在植物发育中的功能提供了一定的参考。