鸡肉源耐甲氧西林金黄色葡萄球菌全基因组测序及生物信息学分析

作     者：姜华 何晓娟 卢星辰 李晨程 李远宏 JIANG Hua;HE Xiaojuan;LU Xingchen;LI Chencheng;LI Yuanhong

作者机构：徐州医科大学公共卫生学院江苏徐州221004 

出 版 物：《中国病原生物学杂志》 (Journal of Pathogen Biology)

年 卷 期：2023年第18卷第10期

页      面：1117-1121,1126页

核心收录：

学科分类：1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 100705[医学-微生物与生化药学] 1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 100103[医学-病原生物学] 10[医学] 

基　　金：徐州市科技计划项目(No.KC18204) 

主　　题：耐甲氧西林金黄色葡萄球菌 全基因组测序 抗生素耐药基因 毒力基因 

摘      要：目的 了解鸡肉源耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(Methicillin-resistant Staphylococcus aureus,MRSA)的全基因组特征。方法 收集7株鸡肉源MRSA菌进行全基因组测序,利用比较基因组学分析MRSA的基因特征、抗生素耐药基因(Antibiotic resistance genes, ARGs)和毒力基因携带情况,并构建基于MRSA全基因组SNP的系统发育树以分析不同菌株间的进化关系。结果 7株MRSA染色体基因组长度约为2.8 Mbp,鉴定出2 499~2 735个基因,基因组的平均GC含量为33.58%。基因功能注释结果显示测序MRSA菌株基因组中包含大量与营养物质代谢功能和环境响应相关的基因,可能为其在不同环境下的生长繁殖提供有利条件。7株鸡肉源MRSA菌的基因组中检出12~21种ARGs以及53~71种毒力基因。系统发育树显示不同ST型MRSA菌株分别处于不同的分支,而相同ST型MRSA菌株的进化距离较近,遗传进化关系较近。结论 鸡肉源MRSA菌株基因组中存在大量的ARGs和毒力基因,对人类健康造成巨大威胁,因此应持续监测并采取有效措施降低鸡肉制品中MRSA的污染水平,以确保食品安全。