青花椒抗性基因ZaMBF1家族的生物信息学分析和逆境响应研究
Bioinformatics Analysis of the ZaMBF1 Family and Its Expression Pattern under Different Stresses in Zanthoxylum armatum作者机构:四川农业大学林学院长江上游林业生态工程四川省重点实验室成都611130
出 版 物:《四川农业大学学报》 (Journal of Sichuan Agricultural University)
年 卷 期:2023年第41卷第4期
页 面:592-601页
基 金:国家重点研发计划项目(2020YFD1000700、2018YFD1000605) 四川省科技基金计划项目(2020YJ0130) 四川省“十四五”林木育种攻关项目(2021YFYZ0032)。
摘 要:【目的】探究青花椒抗逆调控基因ZaMBF1基因家族特征和非生物胁迫下的表达模式,为青花椒抗性育种提供重要的基因来源和理论基础。【方法】结合近年发表的青花椒基因组数据,综合利用生物信息学研究方法和荧光定量PCR技术,解析了多蛋白侨联因子MBF1家族(multiprotein bridging factor 1)的核酸和蛋白序列特征,探究了ZaMBF1s对盐胁迫和脱落酸处理后的响应模式。【结果】青花椒共有3个MBF1家族成员,分别为ZaMBF1a、ZaMBF1b和ZaMBF1c。其中ZaMBF1a和ZaMBF1b编码序列长度均为429 bp,分别位于26号和32号染色体,而ZaMBF1c编码序列长度为453 bp,位于4号染色体;青花椒ZaMBF1s均为亲水性的不稳定蛋白,其核酸序列和对应的启动子序列均含有丰富的WRKY、bHLH等抗逆调控基因结合位点和顺式作用元件;ZaMBF1家族基因在NaCl外源处理3h后即可快速响应,并在处理后12h再次极显著上调,尤其是ZaMBF1c的上调最为显著;同时,外源处理12h也是ZaMBF1家族基因响应ABA处理的重要时间点。【结论】青花椒ZaMBF1家族成员可以参与抗逆调控过程,并对外源盐和脱落酸处理具有显著响应。本研究所获结果对于探究ZaMBF1基因的分子功能,揭示青花椒抗逆性的调控机制提供了丰富的数据支撑。