基于宏基因组学分析海南省不同养殖场库蠓共生微生物群落组成
A metagenomic analysis of the composition of symbiotic microbial communities in Culicoides on different livestock farms in Hainan Province作者机构：海南大学全健康研究院海南海口570228 海南省疾病预防控制中心海南海口570203
出 版 物：《中国媒介生物学及控制杂志》 (Chinese Journal of Vector Biology and Control)
年 卷 期：2023年第34卷第4期
页 面：472-479页
学科分类：1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 100103[医学-病原生物学] 10[医学]
基 金：国家自然科学基金(U22A20363) 海南省重大科技计划项目(ZDKJ2021035) 海南省重点研发项目(ZDYF2023XDNY061)。
摘 要：目的探究海南省不同养殖场库蠓共生微生物群落多样性和差异性。方法2021年8-9月,在海南省文昌市、定安和乐东县5个不同的养殖场(牛圈、鸡舍、犬场、羊圈和猪圈),用紫外灯诱法采集库蠓,分别使用十六烷基三甲基溴化铵法提取总DNA后,通过宏基因组学测序技术分析其微生物群落结构特征及基因功能分布。结果不同养殖场库蠓优势种不同,牛圈、羊圈和猪圈主要是尖喙库蠓,占比分别为92.91%,82.22%和95.85%;鸡舍和犬场均以荒川库蠓为主要优势种,占比分别为66.36%和98.22%。不同养殖场库蠓共生微生物在门水平上,均以变形菌门(33.78%)、子囊菌门(9.09%)和厚壁菌门(8.88%)为主要菌门;在属水平上,均以不动杆菌属(22.48%)和梭菌属(7.25%)为优势菌属。属水平微生物多样性分析发现5个养殖场共有的属最多,有3357属。微生物基因差异分析显示5个不同的养殖场共有基因数目较少,为1065个。此外,功能预测结果也显示,29.10%注释基因与新陈代谢相关,如碳水化合物代谢、氨基酸代谢和脂质代谢等。基因数目差异分析结果表明,库蠓种类组成越相似,样品共有基因数目越多。结论微生物群落分析发现,海南省不同养殖场库蠓共生微生物的核心菌群相对稳定,库蠓优势种相同的养殖场微生物群落相似度更高。该研究丰富了我国库蠓的微生物群落数据库,对今后库蠓的生物防控有重要意义。
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